结论：在老公和小三同在一个公司且都不愿意离开的情况下，无法通过一份简单的协议来直接约束他们的行为，因为这涉及到个人自由、公司规章制度以及可能的法律限制。不过，可以从婚姻关系维护、公司规章制度利用以及法律途径三个角度来探讨可能的应对策略。
一、婚姻关系维护角度
沟通与协商：
- 首先，尝试与老公进行深入沟通，表达你的感受和担忧，了解他对于这段关系的看法和态度。
- 探讨是否有可能通过协商，让老公主动调整工作安排，比如申请调岗、转部门或者寻找新的工作机会，以减少与小三的接触。
婚姻咨询或心理辅导：
- 如果沟通无果，可以考虑寻求专业的婚姻咨询或心理辅导帮助。
- 专业的咨询师或辅导师可以帮助你们更好地理解彼此的需求和感受，提供有效的沟通技巧和解决方案。
二、公司规章制度利用角度
了解公司政策：
- 查阅公司的员工手册或相关规章制度，了解公司对于员工之间恋爱关系的处理规定。
- 有些公司可能禁止或限制员工之间的恋爱关系，特别是当这种关系可能影响到工作效率或公司形象时。
向公司反映情况：
- 如果公司有相关规定，且老公和小三的行为确实违反了这些规定，你可以考虑向公司的人力资源部门或上级反映情况。
- 公司可能会根据规定采取相应的措施，如调岗、警告或解雇等。但请注意，这一步骤需要谨慎处理，以免引发不必要的法律纠纷或人际关系紧张。
三、法律途径角度
离婚诉讼中的过错赔偿：
- 如果老公的行为构成了婚姻中的过错（如通奸、重婚等），在离婚诉讼中，你可以作为无过错方主张损害赔偿。
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，因一方过错导致离婚的，无过错方有权请求损害赔偿。但需要注意的是，这需要提供充分的证据来证明老公的过错行为。
注意证据收集：
- 在考虑法律途径时，证据的收集至关重要。你可以尝试收集老公与小三之间的通信记录、照片、视频等证据，以证明他们的不正当关系。
- 但请注意，收集证据的过程必须合法合规，不得侵犯他人的隐私权或其他合法权益。
额外建议：
- 在处理这类问题时，保持冷静和理智至关重要。避免采取过激或违法的行为来解决问题，以免给自己带来不必要的麻烦和损失。
- 如果可能的话，寻求专业律师的帮助也是一个明智的选择。律师可以根据你的具体情况提供针对性的法律建议和解决方案。
最后，需要强调的是，每段婚姻和每个家庭的情况都是独特的，因此上述建议可能并不适用于所有情况。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的帮助，请直接向我咨询。