在刑事案件二审期间发现新的犯罪事实时，法院的处理方式需严格遵循相关法律法规及司法实践，以确保审判的公正性和合法性。以下是对此问题的详细解答：

一、基本原则

刑事二审程序的核心在于审查一审判决的认定事实、适用法律以及程序合法性。若在二审期间发现新的犯罪事实，通常不会直接在二审中进行审判，因为二审的主要目的是纠错，而非审理新的犯罪指控。这一原则基于《刑事诉讼法》及相关司法解释，旨在维护审判程序的正当性与专注性。

二、具体处理方式

1. 检察机关补充起诉

   • 情形说明：若二审法院发现新的犯罪事实，且该事实与原审案件有关联，法院可能会将案件发回原审法院，由原审法院通知同级人民检察院进行补充起诉。例如，被告人因某罪一审被判刑，二审期间发现其还有另一项犯罪行为，此时二审法院应将案件发回一审法院，由一审法院通知检察院对新的犯罪行为进行补充起诉。
   • 法律依据：这一处理方式依据《最高人民法院关于适用<中华人民共和国刑事诉讼法>的解释》中的相关规定，明确了二审法院在发现新事实或证据时的处理程序。

2. 新罪另案处理

   • 情形说明：若新发现的犯罪事实与原案关联性不大，或者属于完全独立的犯罪行为，那么该新罪可以由侦查机关另行立案侦查。侦查终结后，由检察院另行提起公诉，并由有管辖权的法院进行审理。例如，被告人因故意伤害罪一审被判决，二审期间发现其在其他地区还实施了抢劫罪，此时可以对抢劫罪单独立案侦查、起诉和审判。
   • 法律依据：根据《刑事诉讼法》及其实践，独立性较强的新罪通常单独处理，以确保审判的公正性和效率。

3. 发回重审

   • 情形说明：对于漏罪（同种或异种），若与原审判决密切相关且可能影响定罪量刑，二审法院可裁定撤销原判，发回原审法院重新审判。重审时，应对新发现的犯罪事实一并审理和判决。若被告人二审期间犯新罪，且新罪与原罪关系密切，涉及刑罚合并等情形，也宜撤销原判、发回重审。
   • 法律依据：这一处理方式主要依据《刑事诉讼法》第二百三十六条，该条款规定了二审法院对上诉、抗诉案件的处理方式，包括撤销原判、发回重审等。

4. 数罪并罚

   • 情形说明：无论通过补充起诉还是另案处理，最终量刑时都需遵循《刑法》第六十九条的规定进行数罪并罚。判决时，除死刑和无期徒刑外，有期徒刑总和刑期需在法定范围内决定，且需考虑各罪的性质和情节。
   • 具体操作：数罪中有判处有期徒刑和拘役的，执行有期徒刑；数罪中有判处附加刑的，附加刑仍需执行。拘役最高不超过一年，有期徒刑总和刑期不满三十五年的，最高不超过二十年；总和刑期超过三十五年的，最高不超过二十五年。

三、保障被告人权益

在处理新罪时，必须确保被告人的合法权益得到充分保障，包括但不限于辩护权、质证权等。法院应严格遵循法定程序，确保审判的公正、合法与透明。

四、结论

刑事二审期间发现新罪是一个复杂且需谨慎处理的问题。法院应根据具体情况，综合考虑新罪的严重性、社会危害性、与被告人原罪的关联度以及被告人的认罪态度等因素，依法作出公正裁判。可能的处理方式包括发回重审、建议补充起诉或另案处理，每种方式均需严格遵守法律规定，确保审判的公正性与合法性，同时保护被告人的合法权益。