核心结论：邻里纠纷协议未履行20年后，处理方式需结合协议性质、诉讼时效、证据情况综合判断，可能涉及继续履行、赔偿损失、协议无效或可撤销等情形，具体分以下情况说明：

1. 若协议涉及物权归属或长期权利义务（如土地边界、房屋通行权），可能不受诉讼时效限制

根据《民法典》第196条，请求停止侵害、排除妨碍、消除危险等物权请求权，以及不动产物权和登记的动产物权权利人请求返还财产的请求权，不适用诉讼时效。
举例：若20年前的协议约定“双方以某棵树为界，不得越界建房”，现一方越界建房，另一方仍有权要求拆除并恢复原状，不受20年时间限制。
建议：立即收集协议原件、现场照片、证人证言等证据，向法院起诉要求履行协议或排除妨碍。

2. 若协议涉及债权（如赔偿金、借款），需判断是否超过诉讼时效

根据《民法典》第188条，普通诉讼时效为3年，自权利人知道或应当知道权利受损之日起计算。但若20年间存在“诉讼时效中断”情形（如对方承诺履行、部分履行、双方协商等），时效可能重新计算。
举例：若协议约定“甲方赔偿乙方5000元，于1994年支付”，但甲方未支付，乙方在2000年曾向甲方催款（有书面证据），则时效从2000年起重新计算3年；若无任何中断证据，则乙方起诉要求支付赔偿金的请求可能被驳回。
建议：

• 查找20年间是否向对方主张过权利（如催款记录、录音、证人）；
  
• 若无中断证据，可尝试与对方协商补签还款计划或确认债务，形成新的债权债务关系；
  
• 若对方自愿履行，可接受并保留书面凭证（如收条、转账记录）。

3. 若协议存在重大误解、欺诈、胁迫等情形，可主张撤销或确认无效

根据《民法典》第147-151条，若协议签订时存在重大误解、欺诈、胁迫、显失公平等情形，受损害方有权请求法院或仲裁机构撤销协议，或确认协议无效。
举例：若协议约定“甲方将房屋低价卖给乙方，因乙方威胁甲方家人”，甲方可在知道撤销事由之日起1年内（最长不超过协议签订后5年）起诉撤销协议。
建议：

• 收集证明协议签订时存在法定情形的证据（如威胁录音、虚假陈述的书面材料）；
  
• 尽快向法院起诉，避免超过撤销权行使期限。

4. 若协议内容违法或违背公序良俗，协议自始无效

根据《民法典》第153条，违反法律、行政法规的强制性规定或违背公序良俗的民事法律行为无效。
举例：若协议约定“双方约定将公共通道划归一方使用”，因侵犯其他业主权益，该条款无效。
建议：

• 确认协议内容是否违反法律（如土地管理法、物业管理条例）；
  
• 若无效，可要求恢复原状或赔偿因无效导致的损失。

行动建议总结

1. 收集证据：协议原件、履行情况证明（如照片、证人）、主张权利的证据（如催款记录）；
   
2. 分析协议性质：判断是物权纠纷、债权纠纷还是可撤销/无效情形；
   
3. 选择处理方式：根据性质选择起诉履行、赔偿、撤销或确认无效；
   
4. 及时行动：若涉及债权，避免因时效问题丧失权利；若涉及撤销权，注意行使期限。
   

如有具体协议内容或证据材料，可进一步向我咨询，我会结合细节为您制定更详细的方案。