关于农民耕地是否可以建养工厂（这里以养殖场为例进行说明，因为养工厂概念较为宽泛，而养殖场是常见的农业设施建设类型）的问题，这并非一个简单的“可以”或“不可以”的答案，而是需要根据耕地类型、相关法律法规、申请审批流程以及环保要求等多方面因素来综合判断。
一、耕地类型与用途限制
首先，我们需要明确耕地的类型。在我国，耕地主要分为基本农田和非基本农田（一般耕地）。
基本农田：这是受到特殊保护的耕地，主要用于粮、棉、油、蔬菜等种植业生产。根据相关法律法规，基本农田一律不得占用用于建设养殖场或其他非农业设施。违反这一规定将面临责令限期改正、恢复原种植条件及罚款等处罚。
非基本农田（一般耕地）：在符合相关法律法规、规划要求及环保标准，并办理相关审批手续后，非基本农田可以用于建设养殖场。但需要注意的是，养殖用地仍属于农业用地范畴，其上的建筑设施不应改变土地的基本用途。
二、相关法律法规依据
在判断是否可以在耕地上建设养殖场时，我们需要参考以下法律法规：
《中华人民共和国土地管理法》：该法明确保护耕地，严格控制耕地转为非耕地。未经批准擅自将耕地用于非农业建设是违法行为。
《中华人民共和国畜牧法》：该法支持规模化、标准化养殖，允许在符合规划条件的非基本农田上建设养殖场。
三、申请审批流程
如果您有在耕地上建设养殖场的需求，需要按照以下流程进行申请和审批：
提出申请：首先，您需要向当地农业农村部门和自然资源部门提出书面申请，说明建设养殖场的意图、规模、选址等详细情况。
办理审批：按照法定程序办理用地审批手续，包括生产设施用地的备案、签订用地协议，并在国土局和农业局备案。同时，养殖场的选址还需通过规划局的审批，确保符合当地的土地利用规划和城乡规划。
环保评估：养殖场应遵守环保法规，进行环境影响评价，确保养殖废弃物得到妥善处理，防止环境污染。这是建设养殖场不可或缺的一环。
四、其他注意事项
在建设养殖场的过程中，您还需要注意以下几点：
保护耕地资源：在建设过程中，应特别注意保护耕地资源，不得破坏耕地的耕作层和种植条件。
恢复原用途：如果养殖场用地使用权期限届满或不再使用时，您需要负责将土地恢复至原用途，以确保土地的可持续利用。
政策调整与优化：鉴于地方对设施农业用地政策的调整和优化，建议您在建设前详细咨询当地相关部门，了解最新的政策和审批流程，以确保项目的顺利进行。
综上所述，农民耕地是否可以建养工厂（以养殖场为例）并非一概而论的问题。在符合相关规定并办理完所有审批手续后，方可在非基本农田上建设养殖场。因此，在决定建设前，请务必进行充分的了解和咨询，以避免不必要的法律风险和经济损失。