结论前置：公司因员工原因造成重大损失时，员工是否需要赔偿以及赔偿是否合法，需根据具体情况判断。若员工存在故意或重大过失，公司要求员工赔偿通常是合法的；若员工不存在故意或重大过失，则要求员工赔偿可能不合法。同时，赔偿需满足一定条件，且赔偿方式、限度及流程均需依法依规进行。
一、员工存在故意或重大过失的情况
合法性分析：
- 根据《中华人民共和国民法典》第一千一百九十一条，用人单位的工作人员因执行工作任务造成他人损害的，由用人单位承担侵权责任。但用人单位承担侵权责任后，可以向有故意或者重大过失的工作人员追偿。这意味着，在员工存在故意或重大过失导致公司损失的情况下，公司要求员工承担赔偿责任具有法律依据。
- 同时，《中华人民共和国劳动合同法》也明确规定，劳动者因过错给用人单位造成损失的，应承担赔偿责任。
实例说明：
- 如仓库管理员明知仓库禁止吸烟却仍违规操作，引发火灾并给公司造成巨大财产损失。在此情况下，公司在承担相关责任后，有权向该管理员追偿。
- 又如，财务人员故意泄露公司财务信息，导致公司遭受经济损失，公司同样有权要求该财务人员承担赔偿责任。
赔偿条件与限度：
- 赔偿需满足员工存在过错（包括故意和重大过失）、公司存在实际损失、且损失与员工行为有直接因果关系等条件。
- 赔偿限度方面，根据《工资支付暂行规定》第十六条，从员工工资中扣除赔偿款时，每月扣除部分不得超过其当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地月最低工资标准。
二、员工不存在故意或重大过失的情况
合法性分析：
- 劳动关系具有从属性和风险性，企业作为经营主体应承担一定的经营风险。若员工在工作中不存在故意或重大过失，仅因工作失误或正常工作风险导致公司损失，要求员工承担全部或主要赔偿责任有失公平。
- 在这种情况下，公司要求员工赔偿可能缺乏法律依据，且可能违反劳动法的相关规定。
实例说明：
- 如销售人员按照公司销售策略和流程进行业务推广，但因市场环境变化等不可预见原因导致订单丢失。在这种情况下，让销售人员承担公司损失不合理。
- 又如，生产线上员工按照操作规程进行生产，但因设备故障导致产品瑕疵，给公司造成损失。在此情况下，要求员工承担赔偿责任同样不合理。
三、公司要求员工赔偿的处理流程与建议
协商先行：
- 公司应与员工就赔偿事宜进行友好协商，明确赔偿方式、金额及期限。协商过程中，公司应提供充分的证据证明员工的过错行为与损失之间的因果关系。
依据规章制度：
- 若协商无果，公司可依据已公示的规章制度采取相应措施，如扣除工资或解除劳动合同。但需注意，规章制度需符合法律规定的民主程序制定，并向员工公示，以确保其合法有效。
法律途径保障：
- 在尽责管理仍无法解决问题时，公司可通过劳动仲裁或诉讼等法律手段解决赔偿纠纷。在此过程中，公司需提供充分的证据证明员工的过错行为、损失的存在以及赔偿处理的合法性。
注意文档记录：
- 在整个过程中，公司应保留相关证据和文档，如监控录像、工作记录、第三方鉴定报告等，以证明员工的过错、损失的存在以及赔偿处理的合法性。
四、实际应用中的注意事项
- 公司在制定规章制度时，应明确员工因过错造成损失的赔偿责任，确保制度的合法性和有效性。
- 在处理赔偿问题时，公司应遵循公平、公正的原则，避免过度惩罚员工，维护良好的劳动关系。
- 员工也应增强责任意识，遵守公司规章制度，避免因个人过错给公司带来损失。
综上所述，公司因员工原因造成重大损失时，员工是否需要赔偿以及赔偿是否合法需根据具体情况判断。在处理此类问题时，公司应严格遵循法律规定和合同约定，确保赔偿条件的满足、赔偿范围的合理以及处理流程的规范。同时，公司应注重与员工的沟通协商，维护劳动关系的和谐稳定。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。