针对您提出的“卷烟非法运输怎么处理”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
非法运输卷烟是一种严重的违法行为，其处理方式需根据具体情况来判定，可能涉及行政责任和刑事责任。
一、行政责任
对于非法运输卷烟的行政违法行为，烟草专卖行政主管部门会采取一系列处理措施：
无准运证或超量运输：
- 烟草专卖行政主管部门会对违规者处以罚款，罚款数额通常按照查获地省级烟草专卖行政主管部门出具的上年度烟叶平均收购价格的百分之七十来收购违法运输的烟叶，并按照市场批发价格的百分之七十来收购违法运输的除烟叶外的其他烟草专卖品。
- 若情节严重，还将没收违法运输的烟草专卖品和违法所得。
特定情形下的没收与处罚：
- 若非法运输的烟草专卖品价值超过5万元，或运输卷烟数量超过100件（每1万支为1件），将被视为情节严重，烟草专卖行政主管部门将没收违法运输的烟草专卖品和违法所得。
- 其他特定情形，如被烟草专卖行政主管部门处罚两次以上、抗拒监督检查、非法运输走私烟草专卖品、运输无烟草专卖生产企业许可证的企业生产的烟草专卖品、利用伪装或特种车辆逃避检查等，也将面临同样的没收与处罚。
承运人的责任：
- 承运人若明知是烟草专卖品而为无准运证的单位、个人运输，将由烟草专卖行政主管部门没收违法所得，并处罚款。
- 承运人将无法获得运费，已收的运费需退还，拒不退还的也将依法处理。
二、刑事责任
若非法运输卷烟的行为达到一定的严重程度，将构成犯罪，需承担刑事责任：
非法经营罪：
- 根据《中华人民共和国刑法》第二百二十五条的规定，违反国家规定，非法经营专营、专卖物品（如烟草），扰乱市场秩序，情节严重的，将处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处违法所得一倍以上五倍以下罚金；情节特别严重的，将处五年以上有期徒刑，并处违法所得一倍以上五倍以下罚金或者没收财产。
- 认定标准包括非法经营数额在五万元以上，或者违法所得数额在二万元以上；非法经营卷烟二十万支以上；曾因非法经营烟草专卖品三年内受过二次以上行政处罚，又非法经营且数额在三万元以上的，均视为“情节严重”。非法经营数额在二十五万元以上，或者违法所得数额在十万元以上；非法经营卷烟一百万支以上的，视为“情节特别严重”。
走私普通货物、物品罪：
- 若非法运输卷烟是为了逃避海关监管，偷逃应缴税额达到一定标准，即构成走私普通货物、物品罪。
- 根据《中华人民共和国刑法》第一百五十三条的规定，走私除特定物品外的货物、物品，偷逃应缴税额较大或者一年内曾因走私被给予二次行政处罚后又走私的，将处三年以下有期徒刑或者拘役，并处偷逃应缴税额一倍以上五倍以下罚金；偷逃应缴税额巨大或有其他严重情节的，将处三年以上十年以下有期徒刑，并处偷逃应缴税额一倍以上五倍以下罚金；偷逃应缴税额特别巨大或有其他特别严重情节的，将处十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处偷逃应缴税额一倍以上五倍以下罚金或者没收财产。
- 认定标准中，“偷逃应缴税额较大”指偷逃应缴税额在十万元以上不满五十万元；“偷逃应缴税额巨大”指五十万元以上不满二百五十万元；“偷逃应缴税额特别巨大”指二百五十万元以上。
三、总结与建议
非法运输卷烟不仅可能面临严厉的法律制裁，还会对个人和社会造成不良影响。因此，我建议您严格遵守相关法律法规，不参与非法运输卷烟的活动。对于烟草行业从业者及承运人而言，更应增强法律意识，确保合法合规经营和运输。若您或他人不慎涉及此类违法行为，建议及时咨询专业律师，以便准确了解自身法律责任及可能的法律后果。