结论：单位扣绩效工资不从工资里直接扣，而让员工单独拿钱的情况，可能涉及多种原因和法律考量，以下从不同角度进行分析。

一、绩效工资的性质与发放方式

绩效工资，顾名思义，是与员工的工作绩效直接挂钩的工资部分。它不同于基本工资，基本工资是员工因提供劳动而获得的固定报酬，而绩效工资则是根据员工的工作表现、工作成果或完成的任务量等因素来确定的变动报酬。因此，绩效工资的发放方式、时间和条件，往往由用人单位与员工在劳动合同或规章制度中约定。

1. 单独发放的可能原因：

• 便于管理：用人单位可能认为，将绩效工资与基本工资分开发放，可以更清晰地展示员工的收入构成，便于进行工资管理和财务核算。
• 激励作用：通过单独发放绩效工资，用人单位可以更直观地体现对员工工作表现的认可和奖励，从而激发员工的工作积极性和创造力。
• 合同或制度约定：如果劳动合同或用人单位的规章制度中明确规定了绩效工资的发放方式为单独发放，那么用人单位就有权按照约定执行。

2. 法律考量：

• 合同自由原则：在劳动合同中，用人单位与员工可以就工资的构成、发放方式等事项进行约定，只要这种约定不违反法律法规的强制性规定，就是有效的。
• 工资支付规定：根据《工资支付暂行规定》等相关法律法规，用人单位应当按照劳动合同或规章制度的规定，按时足额支付员工的工资。这包括基本工资和绩效工资等所有组成部分。

二、单位扣绩效工资的合法性分析

1. 合法扣除的情况：

• 员工违约或违规：如果员工违反了劳动合同或用人单位的规章制度，用人单位有权根据约定扣除相应的绩效工资。但这种扣除应当合理，且不得违反法律法规的强制性规定。
• 绩效考核不达标：如果员工的绩效考核结果未达到用人单位设定的标准，用人单位有权根据约定扣除相应的绩效工资。但同样，这种扣除应当合理，且应当事先告知员工绩效考核的标准和方式。

2. 非法扣除的情况：

• 无合法依据扣除：如果用人单位没有合法的依据（如劳动合同、规章制度等）而擅自扣除员工的绩效工资，那么这种行为就是违法的。
• 扣除过多或不合理：即使用人单位有合法的依据扣除员工的绩效工资，但如果扣除的金额过多或不合理，也可能构成违法。例如，扣除的金额超过了员工当月应得绩效工资的总额，或者扣除的理由与员工的实际工作表现不符等。

三、员工应对建议

1. 了解合同和制度：

• 员工应当仔细阅读劳动合同和用人单位的规章制度，了解绩效工资的发放方式、扣除条件和标准等事项。

2. 保留证据：

• 如果员工认为用人单位的扣除行为违法或不合理，应当及时保留相关证据（如工资条、绩效考核结果、劳动合同等），以便在需要时维护自己的合法权益。

3. 寻求法律援助：

• 如果员工与用人单位就绩效工资的扣除问题发生争议，可以寻求法律援助或咨询专业律师，了解自己的权利和义务，并寻求合理的解决方案。

4. 协商与调解：

• 在争议发生后，员工可以尝试与用人单位进行协商或调解，以达成双方都能接受的解决方案。如果协商或调解无果，再考虑通过法律途径解决争议。

总之，单位扣绩效工资不从工资里直接扣而让员工单独拿钱的情况，可能涉及多种原因和法律考量。员工应当了解自己的权利和义务，并在必要时寻求法律援助或咨询专业律师以维护自己的合法权益。如果你有更多关于劳动工伤（工资福利）方面的问题，可以直接向我咨询。