核心结论：非机动车负主要责任且机动车定损5000元的情况下，机动车方的损失需按责任比例分担，非机动车方可能需承担部分赔偿，具体处理需结合事故细节和法律规定。以下是详细分析：

1. 责任比例与赔偿原则

根据《道路交通安全法》第七十六条，机动车与非机动车发生交通事故时：

• 非机动车负主要责任：通常指非机动车方存在闯红灯、逆行、违规变道等过错，需承担70%-90%的责任（具体比例由交警认定）。
• 机动车定损5000元：若机动车方无过错（如未超速、未违规），非机动车方需按责任比例赔偿其损失。例如，若认定非机动车负70%责任，则需赔偿5000×70%=3500元。

2. 赔偿范围与限制

• 机动车方损失：包括车辆维修费、施救费等直接损失，需提供正规发票或定损报告。
• 非机动车方赔偿能力：若非机动车方为个人且无保险，可能面临执行困难。此时，机动车方可通过法院申请强制执行，但若对方无财产可供执行，赔偿可能难以全额实现。
• 机动车方过错：若机动车方存在过错（如未避让、超速），需先扣除其自身责任比例。例如，若机动车方负30%责任，则非机动车方仅需赔偿剩余70%中的部分。

3. 处理流程建议

1. 固定证据：
   • 保留交警出具的《交通事故责任认定书》，明确责任比例。
   • 收集机动车方的定损报告、维修发票等证据。
2. 协商解决：
   • 双方可协商赔偿金额及支付方式，签订书面协议。
3. 诉讼途径：
   • 若协商不成，机动车方可向法院起诉，要求非机动车方按责任比例赔偿。
   • 法院会根据证据和法律规定判决赔偿金额。

4. 特殊情形提示

• 非机动车方无过错：若事故完全由机动车方导致（如违规驾驶），非机动车方无需赔偿。
• 机动车方未投保：若机动车未购买交强险或商业险，其损失需自行承担部分责任（但非机动车方仍需按责任比例赔偿）。

总结：非机动车方需根据责任比例承担机动车方的损失，但具体赔偿金额需结合事故细节和证据确定。建议双方优先协商，若无法达成一致，可通过法律途径解决。如有进一步疑问，可直接向我咨询。