当非机动车在交通事故中被认定为主要责任方，并需要赔付机动车车损时，其赔付流程和责任承担方式主要依据《中华人民共和国道路交通安全法》及其实施条例等相关法律法规。以下是一个详细且有条理的解答：
一、明确赔偿责任划分
主次责任赔偿原则：
- 根据事故责任认定书，非机动车主责通常意味着需承担70%-90%的赔偿责任，具体比例由交警部门根据事故情况确定。
- 机动车次责则承担剩余比例的赔偿责任。
- 若涉及多方责任主体，需按各自过错程度分摊赔偿金额。
保险优先赔付机制：
- 机动车的交强险在责任限额内（通常为2000元财产损失赔偿限额）会先行赔付非机动车（若有机动车损失，此部分实际是赔付给机动车车主以修复其车辆）的损失（但在此场景下，我们关注的是非机动车对机动车车损的赔付，所以交强险的这部分主要是机动车车主用来减少自己损失的，非机动车主责下的赔付需考虑超出交强险的部分）。
- 超出交强险限额的部分，由机动车的商业险（如果购买）或非机动车责任人按比例分担。
- 非机动车若投保了意外险等商业保险，且该保险覆盖此类事故，非机动车主责方也可同步申请理赔，但需注意这通常是非机动车自身的损失赔付，对于机动车车损的赔付，主要依赖非机动车责任人的个人财产或相关责任保险（如果非机动车有购买针对第三方财产损失的保险）。
二、非机动车主责方的赔付流程（针对机动车车损）
确定机动车车损金额：
- 机动车车主应提供车辆维修发票、维修清单或保险公司定损报告等，以证明车损金额。
计算非机动车应赔付金额：
- 计算公式：（机动车车损金额）×（非机动车责任比例，如80%）。
- 示例：机动车维修费为3万元，非机动车主责（假设责任比例为80%），则非机动车需承担2.4万元（3万×80%）。
赔付方式：
- 非机动车责任人可直接向机动车车主支付赔付金额。
- 若非机动车责任人购买了相关责任保险（虽然非机动车通常不强制购买此类保险，但若有），可由保险公司直接赔付给机动车车主。
三、非机动车主责方的赔付注意事项
保留证据材料：
- 非机动车责任人必须留存事故现场照片、医疗票据（如果有人员受伤）、收入证明（如果涉及误工费赔偿）、机动车车损证明等关键证据，以避免因材料缺失导致索赔受阻或无法有效抗辩。
及时报案处理：
- 事故发生后，非机动车责任人应立即报警并通知相关保险公司（如果涉及保险理赔）。
- 超过法定时效可能影响责任认定结果和赔付效率。
协商与诉讼选择：
- 建议通过交警调解达成书面协议，明确赔付金额和方式。
- 若协商未果，非机动车责任人或机动车车主可在三年内提起诉讼，否则可能丧失胜诉权。
特殊情形应对：
- 若非机动车存在酒驾、逆行等违法行为，可能面临行政处罚甚至刑事责任，同时这也会影响民事赔偿责任的划分。
- 机动车若存在超速、未按规定让行等过错，非机动车责任人可主张减轻自身赔偿责任。
四、特殊情况说明
- 如果非机动车全责，那么非机动车责任人需要承担机动车车损的全部赔偿责任（超出交强险无责赔付限额的部分）。
- 在某些情况下，如果非机动车驾驶人故意碰撞机动车造成事故，机动车一方可能不承担赔偿责任，全部责任由非机动车驾驶人承担。
综上所述，非机动车在交通事故中被认定为主要责任方时，需要按照法律法规的规定和事故责任认定书的比例来赔付机动车车损。在处理此类问题时，建议当事人及时报警、保留证据，并咨询专业律师或相关机构以确保自身权益得到妥善维护。