核心结论：公司虚开增值税专用发票且对方未转款，可能涉及刑事风险、行政处罚及民事纠纷，需根据具体情况采取补救措施。以下从法律风险、应对策略、证据收集三个角度展开分析：

1. 法律风险分析

• 刑事风险：虚开增值税专用发票属于《刑法》第205条规定的犯罪行为，无论对方是否转款，只要存在“为他人虚开、为自己虚开、让他人为自己虚开、介绍他人虚开”行为，且虚开税款数额较大（通常1万元以上或造成国家税款损失5000元以上），即可能构成犯罪。未转款可能影响“骗取税款目的”的认定，但不影响虚开行为的定性。
• 行政处罚：即使未达到刑事立案标准，税务机关也可依据《税收征收管理法》第63条，对虚开发票行为处以补缴税款、滞纳金及0.5倍至5倍罚款。
• 民事纠纷：若虚开行为基于真实交易（如“走账”未实际付款），可能涉及合同违约或不当得利，需承担返还财产、赔偿损失等民事责任。

2. 应对策略建议

• 立即自查整改：
  • 停止虚开行为，收回已开具的发票并作废或红冲；
  • 梳理交易流程，确认是否存在真实业务背景（如部分款项未支付但服务已提供）；
  • 补缴因虚开导致的少缴税款及滞纳金，降低行政处罚风险。
• 主动配合调查：
  • 若税务或公安机关已介入，需如实说明情况，提供交易合同、物流单据、沟通记录等证据；
  • 避免隐瞒或伪造证据，否则可能加重处罚。
• 协商补救措施：
  • 与对方协商补转款项或签订补充协议，证明交易真实性；
  • 若对方拒绝配合，可考虑通过民事诉讼追讨款项（需有真实交易基础）。

3. 证据收集要点

• 交易真实性证据：合同、送货单、验收单、聊天记录等，证明业务实际发生；
• 款项往来证据：银行流水、转账记录、收据等，证明资金流向（即使未转款，也可说明原因）；
• 沟通记录：与对方就发票开具、款项支付的协商记录，证明无主观故意。

特别提醒：虚开发票的刑事风险不因对方未转款而消除，建议尽快委托律师介入，评估案件严重程度并制定辩护策略。若需进一步分析，可直接向我提供交易细节（如发票金额、未转款原因等），我将结合具体情形给出针对性建议。