烟草行政处理案件未按时办理结案的，主要涉及对烟草专卖行政主管部门的责任追究，一般不会直接对当事人（如违法经营者）进行处罚，但可能因行政机关的拖延而间接影响当事人的权益。具体责任追究方式如下：

1. 内部监督与责任追究
   根据《烟草专卖行政处罚程序规定》及相关法律法规，烟草专卖行政主管部门若未在法定期限内办理结案，可能面临内部监督机制的约束。上级烟草专卖行政主管部门或同级人民政府有权责令其改正，并对直接负责的主管人员和其他直接责任人员依法给予行政处分。这种处分可能包括警告、记过、记大过、降级、撤职或开除等，具体取决于违规情节的严重程度。

2. 对当事人权益的间接影响
   虽然未按时结案本身不直接对当事人进行处罚，但可能因行政机关的拖延而影响当事人的合法权益。例如，若案件涉及查封、扣押的财物，未及时结案可能导致财物长时间被扣押，影响当事人的正常经营或生活。此外，若当事人因行政机关的拖延而遭受其他损失，如名誉损害、经济损失等，可能依法享有要求赔偿的权利。

3. 特殊情况下的直接责任
   在极少数情况下，若未按时结案是由于当事人的故意阻碍或提供虚假信息等行为导致的，当事人可能因此承担相应的法律责任。但这种情况较为特殊，且需有充分证据证明当事人的过错与未按时结案之间存在直接因果关系。

建议：

• 若您是案件当事人，发现烟草专卖行政主管部门未按时办理结案，可首先向该部门提出书面催办申请，要求其说明原因并尽快结案。
  
• 若催办无果，您可向上级烟草专卖行政主管部门或同级人民政府投诉，请求其介入调查并督促结案。
  
• 若因未按时结案给您造成损失，您可依法向行政机关提出赔偿请求，或通过法律途径维护自身权益。
  

我是专注于行政法领域的律师，若您在烟草行政处理案件中遇到任何法律问题，欢迎直接向我咨询。