若烟草行政处罚两次后第三次又出现违法行为，通常会面临更严厉的处罚，具体处理方式需结合违法情节、性质等因素综合判定，一般包括罚款、没收违法所得、责令停业整顿甚至吊销许可证等。以下从不同角度为你详细分析：

1. 从法律规定的处罚种类角度
   • 罚款：根据《中华人民共和国烟草专卖法》及其实施条例等相关法律法规，对于多次违反烟草专卖管理规定的行为，罚款的幅度通常会比前两次更高。例如，前两次可能只是按照较低标准处以一定金额的罚款，第三次违法时，罚款金额可能会根据违法行为的严重程度，在法定幅度内大幅提升，可能是前几次罚款金额的数倍。
   • 没收违法所得：如果第三次违法行为存在违法所得，执法部门会依法予以没收。违法所得是指通过违法经营烟草制品等活动所获得的全部收入，扣除成本后的利润部分。没收违法所得旨在剥夺违法者的非法利益，遏制其继续违法的动机。
   • 责令停业整顿：对于情节较为严重的第三次违法行为，烟草专卖行政主管部门可以责令违法者停业整顿。停业整顿的期限会根据违法情节的轻重确定，一般在一定时间范围内，如7天至数月不等。在停业整顿期间，违法者不得继续从事烟草专卖经营活动，需要对其经营行为进行全面整改，以符合法律法规的要求。
   • 吊销许可证：若第三次违法行为情节特别严重，如多次销售假冒伪劣烟草制品、严重扰乱烟草市场秩序等，烟草专卖行政主管部门有权吊销违法者的烟草专卖零售许可证等相关许可证。吊销许可证意味着违法者将失去从事烟草专卖经营活动的合法资格，且在一定期限内甚至永久不得再次申请相关许可证。
2. 从违法情节对处罚的影响角度
   • 违法行为的性质：如果第三次违法行为涉及销售假烟、走私烟等严重违法犯罪行为，与一般的超范围经营或未按规定摆放烟草制品等违法行为相比，处罚会更为严厉。销售假烟、走私烟不仅违反了烟草专卖管理规定，还可能涉及生产、销售伪劣产品罪、走私普通货物罪等刑事犯罪，除了行政处罚外，还可能面临刑事追究。
   • 违法行为的规模：违法行为的规模也是影响处罚的重要因素。如果第三次违法行为的经营规模较大，如销售数量多、销售额高，对烟草市场秩序造成的损害也更大，那么处罚力度会相应加重。例如，对于大规模销售非法烟草制品的行为，可能会面临更高额度的罚款、更长时间的停业整顿甚至直接吊销许可证。
   • 违法行为的后果：如果第三次违法行为导致了严重的后果，如引发了群体性事件、造成了重大经济损失或社会影响等，烟草专卖行政主管部门会从重处罚。例如，因销售劣质烟草制品导致消费者健康受到严重损害的，违法者不仅要承担行政处罚责任，还可能面临消费者的民事赔偿诉讼。
3. 从执法程序角度
   • 立案调查：烟草专卖行政主管部门在发现第三次违法行为后，会依法进行立案调查。调查过程中，执法人员会收集相关证据，如现场检查笔录、询问笔录、照片、视频等，以证明违法事实的存在。
   • 告知权利：在作出行政处罚决定前，执法部门会告知违法者拟作出处罚的事实、理由、依据及其享有的陈述、申辩、要求听证等权利。违法者可以在规定的时间内行使这些权利，提出自己的意见和证据。
   • 作出处罚决定：经过调查和听取违法者的陈述、申辩后，烟草专卖行政主管部门会根据违法事实和法律规定，作出相应的行政处罚决定。处罚决定会以书面形式送达违法者，并告知其不服处罚决定的救济途径和期限。
   • 执行处罚：如果违法者在规定的期限内未申请行政复议或提起行政诉讼，且不履行处罚决定，烟草专卖行政主管部门可以依法申请人民法院强制执行，确保处罚决定得到有效执行。

在实际处理过程中，每个案件的具体情况都有所不同，烟草专卖行政主管部门会根据违法事实、情节以及社会危害程度等因素，依法作出公正、合理的处罚决定。如果你遇到了相关问题或有进一步的疑问，欢迎随时向我咨询。