根据《中华人民共和国烟草专卖法》及其实施条例，针对一年内违规两次的处理方式，需结合违规行为的具体类型和情节严重程度综合判断。以下是分情况说明：

1. 若两次违规均涉及无证运输或销售烟草制品

   • 行政处罚：根据《烟草专卖法实施条例》第五十二条，未取得烟草专卖零售许可证经营烟草制品零售业务的，由工商行政管理部门或烟草专卖行政主管部门责令停止经营，没收违法所得，并处以违法经营总额20%以上50%以下的罚款。
     
   • 加重情节：若两次违规间隔时间较短（如半年内），或存在抗拒执法、隐匿证据等情形，可能被认定为“情节严重”，处罚幅度可能接近上限（如50%罚款），甚至面临吊销营业执照的风险。

2. 若两次违规涉及销售非法生产的烟草制品（如假烟、走私烟）

   • 行政处罚：根据《烟草专卖法实施条例》第五十八条，销售非法生产的烟草制品的，由烟草专卖行政主管部门责令停止销售，没收违法所得，处以违法销售总额20%以上50%以下的罚款，并将非法销售的烟草制品公开销毁。
     
   • 刑事风险：若两次违规涉及金额较大（如单次违法销售总额超过5万元），可能触犯《刑法》第二百二十五条“非法经营罪”，面临五年以下有期徒刑或拘役，并处或单处违法所得一倍以上五倍以下罚金。

3. 若两次违规涉及未在当地烟草专卖批发企业进货

   • 行政处罚：根据《烟草专卖法实施条例》第五十六条，取得烟草专卖零售许可证的企业或个人未在当地烟草专卖批发企业进货的，由烟草专卖行政主管部门没收违法所得，可处以进货总额5%以上10%以下的罚款。
     
   • 累积效应：若两次违规均因未在当地进货，且进货总额较高，可能被认定为“屡教不改”，处罚幅度可能接近上限（如10%罚款），甚至影响许可证续期。

建议行动：

1. 立即整改：停止所有违规行为，主动向当地烟草专卖行政主管部门说明情况，配合调查。
   
2. 申请听证：若对处罚决定有异议，可在收到处罚告知书后3日内申请听证，维护合法权益。
   
3. 合规经营：加强内部管理，确保所有经营活动符合《烟草专卖法》要求，避免再次违规。
   

如有具体案件细节（如违规类型、金额、时间等），可进一步向我咨询，我将结合实际情况提供更精准的法律建议。