行政案件在办理期限内没有办结的，之后是否还会处罚，需视具体情况而定。以下从多个角度进行分析：
一、行政处罚的时效性
一般规定：
- 根据《中华人民共和国行政处罚法》的相关规定，行政处罚的时效性通常与违法行为的发生和发现时间有关。一般来说，如果违法行为在二年内未被发现的，不再给予行政处罚；涉及公民生命健康安全、金融安全且有危害后果的，上述期限延长至五年。但这一规定主要针对的是违法行为被发现前的时效问题，而非行政案件办理期限内的时效。
办理期限内的处理：
- 如果行政案件在办理期限内，行政机关已经对违法行为进行了调查取证，并确定了违法事实，那么即使办理期限未满，行政机关也有权依法作出行政处罚决定。
- 如果行政案件在办理期限内未办结，但行政机关已经掌握了足够的证据证明违法行为的存在，且该违法行为未超过上述时效性规定，那么行政机关在办理期限届满后仍可继续处理，并依法作出行政处罚。
二、办理期限届满后的处理
继续办理：
- 如果行政案件在办理期限内未办结，且行政机关认为需要继续调查取证的，可以依法延长办理期限或采取其他措施继续办理。在此情况下，如果最终确定了违法事实，行政机关仍可依法作出行政处罚。
终止办理：
- 如果行政案件在办理期限内未办结，且行政机关认为无法继续调查取证或违法事实无法确定的，可以依法终止办理。在此情况下，行政机关通常不会作出行政处罚决定。但需要注意的是，如果后续发现了新的证据或线索，行政机关仍可重新启动办理程序。
特殊情况：
- 在某些特殊情况下，如涉及复杂案件、需要听证等程序，行政案件的办理期限可能会相应延长。在此情况下，只要行政机关在延长后的期限内作出了行政处罚决定，且该决定符合法律规定，就是有效的。
三、法律建议
对于行政机关：
- 行政机关应严格按照法定程序和时限办理行政案件，确保在办理期限内完成调查取证、审查决定等工作。
- 如果确实需要延长办理期限的，应依法办理延期手续，并告知当事人相关情况。
对于当事人：
- 如果当事人认为行政机关在办理行政案件过程中存在违法行为或不当行为的，可以依法提出申诉或申请行政复议、提起行政诉讼等。
- 当事人应积极配合行政机关的调查取证工作，提供必要的证据和资料，以便行政机关尽快作出处理决定。
总结来说，行政案件在办理期限内没有办结的，之后是否还会处罚取决于多种因素，包括违法行为的时效性、行政机关的调查取证情况、办理期限是否延长等。如果仍有疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。