结论：病假未用完时申请劳动能力鉴定，原则上不影响继续使用剩余病假，但需结合具体情形判断。以下是分情况说明：

1. 病假与劳动能力鉴定的法律性质

• 病假：属于劳动者因患病或非因工负伤需暂停工作接受治疗的医疗期，期间用人单位需支付病假工资（通常为工资的60%-100%，具体比例依地方规定）。
• 劳动能力鉴定：针对劳动者因工负伤或患职业病导致的劳动功能障碍程度和生活自理障碍程度的评定，结果用于确定工伤待遇（如伤残津贴、一次性伤残补助金等）。若病假原因属于非工伤疾病，则劳动能力鉴定可能不适用，需确认鉴定申请的合法性。

2. 病假未用完时申请劳动能力鉴定的影响

• 若病假原因属于非工伤疾病：
  • 劳动能力鉴定通常不适用于非工伤情形，此时申请可能被鉴定机构驳回。
  • 病假期间仍受《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》保护，用人单位不得随意解除劳动合同，劳动者可继续使用剩余病假。
• 若病假原因属于工伤：
  • 劳动者在医疗期内可申请劳动能力鉴定，鉴定结果不影响医疗期计算。
  • 根据《工伤保险条例》，医疗期（即停工留薪期）一般不超过12个月，特殊情况可延长，但需经劳动能力鉴定委员会确认。若医疗期未满，劳动者可继续享受工伤待遇（包括原工资福利待遇），无需消耗“病假”额度（因工伤医疗期与病假性质不同）。

3. 实务操作建议

• 明确病假性质：先确认病假是因非工伤疾病还是工伤导致，前者适用医疗期规定，后者适用工伤停工留薪期规定。
• 与用人单位沟通：申请劳动能力鉴定前，建议与用人单位协商，避免因程序问题影响病假权益。
• 保留证据：保存病历、诊断证明、病假单等材料，以备鉴定或劳动争议时使用。

4. 风险提示

• 若用人单位以“申请劳动能力鉴定”为由单方面终止病假或降低待遇，可能涉嫌违法解除劳动合同，劳动者可主张赔偿金（按经济补偿标准的2倍）。
• 若劳动者虚构病情申请鉴定或病假，可能面临用人单位追责及行政处罚。

总结：病假未用完时申请劳动能力鉴定，原则上不影响剩余病假的使用，但需区分病假性质（工伤/非工伤）并遵守法定程序。如有具体争议，建议提供详细材料进一步分析。