公司内发生刑事案件，公司是否有责任需根据具体情况判断，主要包括单位本身、直接负责的主管人员和其他直接责任人员承担责任，特定情况下个人也可能独立承担责任。以下是对此问题的详细分析：
一、单位犯罪的责任主体
单位本身：
- 当公司实施的犯罪行为符合单位犯罪的构成要件时，即该行为由单位决策机构决定，违法所得归单位所有，单位将作为犯罪主体被判处相应刑罚，通常是判处罚金。例如，公司为了谋取非法利益，集体决定实施走私、偷税等犯罪行为，此时公司需承担刑事责任。
直接负责的主管人员和其他直接责任人员：
- 在单位犯罪中，除了对单位判处罚金外，还需对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员判处刑罚。这些人员包括在单位犯罪中起决定、批准、授意、纵容、指挥等作用的主管负责人，以及具体实施犯罪并起较大作用的经营管理人员或职工。例如，公司财务总监明知公司走私仍批准付款，或者采购经理直接参与走私活动，他们都将承担刑事责任。
二、法律依据
- 根据《中华人民共和国刑法》第三十条和第三十一条的规定，公司、企业、事业单位、机关、团体实施的危害社会的行为，法律规定为单位犯罪的，应当负刑事责任。单位犯罪的，对单位判处罚金，并对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员判处刑罚。
三、特殊情况下的责任承担
个人独立承担责任：
- 如果公司中的某个员工基于个人意志，为了个人目的实施犯罪行为，与公司业务或公司意志无关，那么该个人将独立承担刑事责任，公司通常不承担责任。例如，员工利用职务便利私自侵占公司客户资金，或者员工个人贩卖毒品等，这些行为与公司无关，公司不承担责任。
自然人假借公司名义犯罪：
- 在这种情况下，刑事责任由该自然人承担，公司本身不承担责任。这是因为犯罪行为并非由公司决策或实施，而是自然人的个人行为。例如，某人冒用公司名义签订虚假合同骗取财物，此时公司不承担责任，由该自然人承担刑事责任。
股东的责任：
- 股东原则上不承担公司的刑事责任。然而，如果股东知情甚至帮助公司进行违法犯罪活动，则可能会受到刑事处罚。这是基于共犯原理，即明知他人犯罪而提供帮助或参与其中的行为也构成犯罪。例如，股东明知公司走私仍提供资金支持，或者股东直接参与公司走私活动，他们都将承担刑事责任。
四、综合分析与应用
在确定公司刑事责任的承担主体时，应综合考虑案件的具体事实、法律规定以及相关司法解释。首先判断犯罪行为是否属于单位犯罪，进而确定单位本身是否需要承担刑事责任；其次分析直接负责的主管人员和其他直接责任人员的具体行为及其在公司犯罪中的作用，以确定他们的刑事责任；最后考虑是否存在特殊情况，如个人独立犯罪或自然人假借公司名义犯罪等，以确定最终的责任承担者。
举例说明：
- 假设某公司为了谋取非法利益，集体决定实施走私犯罪行为。在此情况下，公司作为单位犯罪主体将被判处罚金，同时公司的直接负责的主管人员（如总经理）和其他直接责任人员（如采购经理、财务总监等）也将被判处相应的刑罚。
- 假设某公司员工利用职务便利私自侵占公司客户资金。在此情况下，该员工将独立承担刑事责任，公司通常不承担责任。
综上所述，公司刑事责任的承担主体是一个涉及多个法律知识点的复杂问题。在实际应用中，需要根据具体案件的事实和法律规定进行综合分析和判断。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。