在盗窃案中，被公安扣押的赃款（或赃物，因为处理原则相似）的处理是一个严谨且遵循法律程序的过程。以下是对这一问题的详细解答：
一、扣押与保管
扣押程序：
- 公安机关在侦查过程中，一旦发现涉嫌盗窃的赃款或赃物，会立即进行扣押。
- 扣押时，会制作详细的扣押清单，记录赃款或赃物的名称、数量、特征等信息，并由侦查人员、见证人和持有人签名或盖章，以确保扣押的合法性和透明度。
保管措施：
- 扣押后的赃款或赃物会被妥善保管，防止丢失、损坏或被盗。
- 对于易腐烂、变质等不宜长期保存的物品，经县级以上公安机关负责人批准，可以在拍照或录像后委托有关部门进行变卖或拍卖，但所得款项会存入指定账户，等待后续处理。
二、追缴与退赔
追缴工作：
- 公安机关会积极追缴被盗的赃款或赃物，包括通过调查取证、追踪赃物流向等方式。
- 若赃款或赃物已被转移或销售，公安机关会尽力追回，并依法追究相关人员的法律责任。
退赔程序：
- 对于追回的赃款或赃物，公安机关会及时返还给被害人。
- 若赃款或赃物无法追回或已损坏，犯罪嫌疑人、被告人应依法退赔被害人的经济损失。这通常通过法院判决或调解来实现。
三、没收与上缴国库
没收规定：
- 根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，犯罪分子违法所得的一切财物应当予以追缴或者责令退赔；对被害人的合法财产，应当及时返还；违禁品和供犯罪所用的本人财物，应当予以没收。
- 没收的财物和罚金，一律上缴国库，不得挪用和自行处理。
上缴国库流程：
- 没收后的赃款（或变卖、拍卖赃物所得的款项）会按照规定上缴国库。
- 上缴前，可能会进行公告，以寻找被害人或相关权利人，确保处理的公正性和合法性。
四、特殊情况下的处理
善意取得：
- 如果赃款或赃物被第三人善意取得（即第三人在不知情的情况下以合理价格获得），且符合法律规定的善意取得条件，则第三人可以取得该财物的所有权。
- 在此情况下，原所有人（被害人）的损失应由盗窃者承担赔偿责任。
无人认领的赃款或赃物：
- 对于长时间无人认领的赃款或赃物，公安机关可以按照规定进行处理，如拍卖所得款项上缴国库或进行销毁等。
综上所述，盗窃案中被公安扣押的赃款会经过严格的扣押、保管、追缴、退赔、没收和上缴国库等程序，以确保处理的公正性、合法性和透明度。如果您或他人涉及此类案件，建议积极配合公安机关的调查工作，并咨询专业律师以获取更详细的法律指导。