合同提前离职扣1000元是否合理，需视具体情况而定。以下从不同角度为您详细分析：
一、合法情形
存在法定或约定扣除事由：
- 若您违反了与用人单位签订的劳动合同中关于违约责任的约定，比如违反保密协议、竞业限制条款，或给单位造成经济损失等，用人单位按照约定扣除1000元作为赔偿，这种情况下可能是合法的。但需注意，扣除的金额需合理，且不得违反相关法律法规的限制。
经济损失赔偿：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关规定，若因您本人原因给用人单位造成经济损失，用人单位可按照劳动合同的约定要求您赔偿经济损失。但每月扣除的部分不得超过您当月工资的20%，且扣除后的剩余工资部分不得低于当地月最低工资标准。若扣除1000元后，您的工资仍高于当地月最低工资标准，且符合合同约定，则可能是合法的。
二、不合法情形
无合法扣除事由：
- 若不存在上述法定或约定的可扣除情形，用人单位随意扣除1000元则不合法。根据相关法律规定，用人单位不得克扣劳动者工资，除非有正当理由。
扣除金额超限：
- 即使存在可扣除的情形，若扣除的金额超过了法律法规的限制（如每月扣除部分超过当月工资的20%，或扣除后剩余工资低于当地月最低工资标准），则用人单位的行为也是不合法的。
三、应对建议
与用人单位协商：
- 若您认为扣除不合理，可先与用人单位进行友好协商，要求其说明扣钱依据并退还不合理扣除的款项。
向劳动监察部门投诉：
- 若协商不成，您可以向当地劳动监察部门投诉，由劳动监察部门责令用人单位改正。
申请劳动仲裁：
- 您也可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，维护自身合法权益。在申请仲裁时，您需要提供相关证据，如劳动合同、工资条、扣除工资的证明等。
四、法律依据
- 《中华人民共和国劳动法》第五十条：工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。
- 《中华人民共和国劳动合同法》及相关规定：关于劳动者给用人单位造成经济损失的赔偿规定，以及每月扣除部分不得超过当月工资的20%，且扣除后的剩余工资部分不得低于当地月最低工资标准的限制。
总结来说，合同提前离职扣1000元是否合理，关键在于是否存在符合法律规定或合同约定的扣除事由，以及扣除的金额是否合法。若您认为扣除不合理，可通过协商、投诉或申请劳动仲裁等方式来维护自身权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。