针对您提出的“若合同上说违约赔偿三个月工资怎么辞职”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
首先，我们需要明确的是，一般情况下，劳动者辞职只需提前三十天以书面形式通知用人单位即可，并不需要支付违约金。违约金通常只在特定情况下需要支付，这主要包括两种情形：一是用人单位为劳动者提供了专项培训，并约定了服务期；二是用人单位与劳动者签订了竞业禁止协议，且劳动者违反了协议规定。
针对您合同中提到的“违约赔偿三个月工资”的条款，我们需要进行以下分析：
查看违约金条款的合理性：
- 如果该违约金是针对专项培训服务期的约定，那么您需要确认单位是否确实为您提供了专业技术培训，并花费了相应费用。同时，违约金的数额不得超过单位提供的培训费用，且应按照未履行的服务期比例分摊。
- 如果该违约金是竞业限制条款下的约定，那么您需要确认在离职后是否违反了到与原单位有竞争关系的单位工作的限制。
按照法定程序辞职：
- 无论合同中是否有违约金条款，您都应按照法定程序辞职。即提前三十天（试用期内提前三天）以书面形式通知用人单位，并办理离职交接手续。
关于违约金的协商与争议解决：
- 如果您认为合同中的违约金条款不合理，或者与单位就违约金的数额或支付方式存在争议，您可以与单位进行协商。
- 如果协商不成，您可以向劳动争议仲裁机构或人民法院申请仲裁或提起诉讼，以维护自己的合法权益。
特别提醒：
- 如果劳动合同中没有关于服务期或竞业限制等特殊约定，那么您提前三十天以书面形式通知用人单位后，可以解除劳动合同，且不需要支付违约金。
- 即使合同中存在违约金条款，但如果该条款违反了法律法规的规定（如违约金数额过高、不合理等），那么该条款可能被视为无效。
综上所述，您在辞职时，应首先查看合同中的违约金条款是否合理，并按照法定程序辞职。如果与单位就违约金问题存在争议，可以通过协商、仲裁或诉讼等方式解决。希望这些解答能对您有所帮助。