公司让员工签放弃追缴公积金的协议是不合法的。以下从多个角度为您详细分析：

一、法律依据

根据《中华人民共和国劳动法》和《住房公积金管理条例》的相关规定，用人单位必须为员工缴纳住房公积金，这是用人单位的法定义务，不能通过任何形式的协议来免除或减轻这一责任。

• 《中华人民共和国劳动法》第七十二条规定：“社会保险基金按照保险类型确定资金来源，逐步实行社会统筹。用人单位和劳动者必须依法参加社会保险，缴纳社会保险费。”虽然此条主要提及社会保险，但住房公积金作为职工的重要福利之一，同样受到法律的保护。
• 《住房公积金管理条例》第十五条明确规定：“单位录用职工的，应当自录用之日起30日内向住房公积金管理中心办理缴存登记，并办理职工住房公积金账户的设立或者转移手续。”这表明用人单位有义务为员工办理住房公积金的缴存手续。

二、协议无效性

员工与公司签订的“放弃追缴公积金协议”违反了法律法规的强制性规定，因此是无效的。即使双方签订了这样的协议，也不能改变用人单位应当为员工缴纳住房公积金的法律事实。如果公司以此为由拒绝为员工缴纳住房公积金，员工有权向相关部门投诉并要求公司履行法定义务。

三、公司的违法后果

如果公司违反法律规定，未为员工缴纳住房公积金，可能会面临以下后果：

1. 行政处罚：住房公积金管理中心有权责令公司限期改正，并处以罚款等行政处罚。
2. 经济赔偿：员工因公司未缴纳住房公积金而遭受损失的（如无法享受公积金贷款的低利率等），有权要求公司进行经济赔偿。
3. 信用受损：公司的违法行为可能会被记录在案，影响其信用评级和商业信誉。

四、员工权益保护

作为员工，您有权要求公司按照法律规定为您缴纳住房公积金。如果公司拒绝履行这一义务，您可以采取以下措施：

1. 与公司协商：首先尝试与公司进行友好协商，要求公司为您补缴住房公积金。
2. 向相关部门投诉：如果协商无果，您可以向当地的住房公积金管理中心或劳动监察部门投诉，要求相关部门介入调查并处理。
3. 寻求法律援助：在必要时，您可以寻求法律援助或咨询专业律师，通过法律途径维护自己的合法权益。

总结来说，公司让员工签放弃追缴公积金的协议是不合法的，员工有权要求公司按照法律规定缴纳住房公积金。如果公司拒绝履行这一义务，员工可以通过协商、投诉或法律途径来维护自己的合法权益。如果您在此过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。