房产证有了动迁协议依然有用。房产证与动迁协议（拆迁协议）的有效性是两个不同层面的问题，二者并不冲突。以下是详细分析：

一. 房产证与动迁协议的有效性

1. 房产证的法律意义：房产证是房屋产权归属的法定凭证，它证明了房屋所有权人对房屋拥有合法权益，包括占有、使用、收益和处分的权利。

2. 动迁协议的法律性质：动迁协议（拆迁协议）是拆迁方与被拆迁人就房屋拆迁补偿等相关事宜达成的合同约定。它的效力主要取决于签订主体是否适格、意思表示是否真实、内容是否合法等要素。

3. 两者关系：房产证的存在并不影响动迁协议的有效性。即使房屋已经办理了房产证，只要动迁协议是双方在平等、自愿、协商一致的基础上签订的，且内容不违反法律法规的强制性规定，那么该动迁协议依然具有法律效力。

二. 房产证在动迁过程中的作用

• 权益证明：房产证作为房屋产权的法定凭证，在动迁过程中可以作为权益证明，帮助房屋所有权人争取合理的拆迁补偿。
• 办理手续：在动迁过程中，可能需要使用房产证来办理相关手续，如拆迁补偿款的领取、新房产权的登记等。

三. 特殊情况下的处理

• 如果动迁协议存在重大误解、欺诈、胁迫等可撤销事由，或者协议内容违法导致无效，那么无论是否有房产证，该动迁协议都可能不具有法律效力。
• 在动迁过程中，如果房屋所有权人对动迁协议有异议，可以依法通过协商、调解、仲裁或诉讼等方式来维护自己的合法权益。

综上所述，房产证有了动迁协议依然有用，二者在法律上并不冲突。房产证作为房屋产权的法定凭证，在动迁过程中具有重要的法律意义；而动迁协议则是拆迁方与被拆迁人之间的合同约定，其有效性主要取决于签订时的法律要素。如有进一步需要，您可以继续咨询我。