工程师挂证不续签协议应包含以下内容才能确保有效：

一. 明确双方信息

1. 协议双方：明确标注甲方（挂证单位）和乙方（挂证工程师）的详细信息，包括单位名称、法定代表人（或负责人）、联系方式等。

二. 协议背景及目的

1. 协议背景：说明双方之前签订的挂证协议已到期或即将到期，双方经协商决定不再续签。
2. 协议目的：明确本协议旨在友好、公正地终止双方的挂证关系，并明确双方的权利和义务。

三. 协议条款

1. 协议终止：双方同意自本协议生效之日起，原挂证协议不再续签，双方挂证关系终止。

2. 证书及资料归还：

   • 乙方应在协议生效之日起的约定时间内（如十个工作日内），将甲方提供的所有证书和资料归还给甲方。
   • 甲方应确保证书的完整性和安全性，如有损坏或丢失，应承担相应的赔偿责任。

3. 业务关系结算：

   • 乙方应在协议生效之日起的约定时间内（如三个月内），将其在甲方处挂靠的所有业务关系进行结算和终止。
   • 甲方应协助乙方完成相关业务的结算工作，确保双方的业务关系得到妥善处理。

4. 财务往来结算：

   • 乙方应在协议生效之日起的约定时间内（如六个月内），将其在甲方处挂靠的所有财务往来款项进行结算和支付。
   • 甲方应提供必要的财务支持，确保双方的财务关系得到妥善处理。

5. 费用及权益：

   • 双方同意，自本协议生效之日起，甲方不再向乙方收取任何形式的挂证费用。
   • 乙方也不再享有甲方提供的任何形式的挂证服务及相关权益。

6. 争议解决：

   • 双方应在本协议生效之日起的约定时间内（如三个月内），将本协议解除过程中产生的所有争议进行协商解决。
   • 如协商不成，任何一方均可向有管辖权的人民法院提起诉讼。

7. 违约责任：

   • 乙方如未按时归还证书或资料、未按时结算业务关系或财务往来款项等，应承担相应的违约责任。
   • 甲方如未协助乙方完成相关业务结算、未提供必要的财务支持等，也应承担相应的违约责任。

四. 协议生效及份数

1. 协议生效：本协议自双方签字或盖章之日起生效。
2. 协议份数：本协议一式两份，甲乙双方各执一份，具有同等法律效力。

五. 签字盖章

1. 签字盖章：双方应在协议上签字或盖章，并注明日期。

我的建议：

• 在起草协议时，务必确保条款清晰、明确，避免使用模糊或含糊不清的表述。
• 双方应就协议内容进行充分协商，确保双方的权利和义务得到平等、公正的体现。
• 如有必要，可咨询专业律师对协议进行审核和修改，以确保其合法性和有效性。

如有进一步需要，您可以继续咨询我。