关于建造师挂证协议书是否具有法律效应的问题，这需要从多个法律层面和行业规定来综合分析。

首先，从法律原则上看，任何违反法律法规强制性规定的协议都是无效的。在工程建设领域，专业技术人员如建造师的注册执业资格是受到严格管理的。如果建造师与注册单位之间不存在真实的劳动关系，而仅仅是通过挂证协议来出租或出借注册执业资格证书，这种行为是违法的，因此基于这种违法行为的协议也是无效的。

其次，从行业规定来看，住房和城乡建设部以及人力资源社会保障部已经多次发布通知，明确严厉打击工程建设领域专业技术人员注册执业资格违规“挂证”现象。这些通知中明确指出，注册单位与实际工作单位不一致、出租出借注册执业资格证书等“挂证”行为是违法违规的，并会受到相应的处罚。因此，建造师挂证协议书不仅无法得到法律的保护，反而可能使相关人员面临法律风险。

再者，挂证行为还可能对工程质量安全造成严重影响。建造师作为工程建设项目的重要负责人，其专业能力和责任心直接关系到工程的质量和安全。如果建造师仅仅是通过挂证来获取利益，而不实际参与工程建设，那么工程的质量和安全就无法得到保障。

综上所述，建造师挂证协议书是不具有法律效应的。这种协议不仅违反了法律法规的强制性规定，也违背了行业规定和职业道德。对于建造师和相关单位来说，应该严格遵守法律法规和行业规定，杜绝挂证行为的发生。如果存在挂证行为，应及时进行整改，以免面临法律风险和行业处罚。

希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的咨询，请随时告诉我。