可以起诉。针对两人合伙做生意时，其中一人贪污3000元的情况，以下是从不同角度的详细分析：
一、法律角度
贪污行为的性质：
- 在合伙关系中，合伙人应当秉持诚信原则，共同管理合伙事务和财产。若其中一人利用职务之便，贪污合伙财产，该行为不仅违反了合伙协议（如果有的话），还可能构成违法行为。
- 虽然3000元的金额可能不构成刑事犯罪中的“贪污罪”（通常贪污罪涉及较大金额），但该行为仍然属于侵占或挪用合伙财产的行为，应当承担相应的民事责任。
起诉的法律依据：
- 根据《中华人民共和国民法典》中关于合伙合同的规定，合伙人应当按照约定的出资方式、数额和缴付期限，履行出资义务。同时，合伙人不得损害合伙企业的利益，不得擅自处分合伙财产。
- 若其中一人贪污合伙财产，其他合伙人有权依据法律规定和合伙协议（如果有的话）向其追偿损失，并可以通过法律途径（如起诉）来维护自己的合法权益。
二、实际操作角度
收集证据：
- 在起诉前，需要收集充分的证据来证明贪污行为的存在。这可能包括财务记录、交易凭证、证人证言等。证据应当真实、合法、有效，能够形成完整的证据链。
起诉流程：
- 准备好起诉状和相关证据后，可以向有管辖权的人民法院提起诉讼。法院将依法审理案件，并根据事实和法律规定作出判决。
- 如果判决支持了原告的诉讼请求，被告将需要承担相应的法律责任，包括返还贪污的财产、赔偿损失等。
考虑成本效益：
- 在决定是否起诉时，还需要考虑成本效益问题。虽然3000元的金额可能不大，但如果起诉成本（如律师费、诉讼费等）过高，或者追回损失的可能性较小，那么起诉可能并不是最佳选择。
- 在这种情况下，可以考虑通过协商、调解等方式来解决纠纷，以降低成本和风险。
三、建议与风险提示
建议：
- 如果决定起诉，建议咨询专业律师以获取更详细的法律建议和指导。律师可以帮助评估案件的胜诉可能性、制定诉讼策略、准备证据材料等。
- 同时，也可以考虑与其他合伙人协商解决纠纷，以维护合伙关系的稳定和和谐。
风险提示：
- 起诉过程中可能存在不确定性和风险，如证据不足、法院判决不利等。因此，在决定起诉前需要充分评估风险和收益。
- 另外，即使胜诉也可能面临执行难的问题，即被告可能无力偿还或拒绝偿还贪污的财产。在这种情况下，可能需要采取进一步的法律措施来强制执行判决。
总结：针对两人合伙做生意时其中一人贪污3000元的情况，可以起诉。但在决定是否起诉前需要充分评估法律角度、实际操作角度以及成本效益问题，并咨询专业律师以获取更详细的法律建议和指导。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。