若检察机关在首次变更起诉后，需再次变更部分认定数额，应当遵循以下法律程序与原则：

1. 法律依据与程序要求
   根据《刑事诉讼法》及相关司法解释，检察机关变更起诉需以书面形式提出，并说明变更理由及依据。若需再次变更部分认定数额，应重新制作《变更起诉决定书》，明确变更内容（如犯罪金额、损失数额等），并附相关证据材料。程序合法性是核心前提，任何变更均需在法庭审理阶段完成，且不得损害被告人的辩护权。

2. 对庭审程序的影响

   • 延期审理的可能性：若再次变更涉及关键事实或证据，法院可能根据《刑事诉讼法》第204条决定延期审理，给予控辩双方充分准备时间。
     
   • 辩护权保障：被告人及其辩护人有权针对新变更内容提出异议、申请调取新证据或要求重新鉴定。例如，若数额变更影响量刑档次（如从“数额较大”变为“数额巨大”），辩护方需重点审查证据链条的完整性。

3. 证据审查的强化要求
   再次变更数额需以新证据或原证据补强为基础。检察机关应提交：

   • 原始财务记录、转账凭证等客观证据；
     
   • 专家鉴定意见（如涉案财产价值评估）；
     
   • 证人证言的补充或修正。
     法院将严格审查证据的三性（真实性、关联性、合法性），若变更缺乏依据，可能不予采纳。

4. 被告人的应对策略

   • 及时行使质证权：对变更数额的证据逐项质证，重点攻击证据来源、鉴定方法等环节；
     
   • 申请法庭调查：若发现关键证据未被调取（如银行流水、第三方审计报告），可依据《刑事诉讼法》第196条申请法庭收集；
     
   • 量刑协商的调整：若数额变更导致量刑预期变化，可与检察机关协商调整认罪认罚从宽幅度。

5. 法院的审查标准
   法院对再次变更的审查重点包括：

   • 变更是否超出起诉范围（如从诈骗罪变更为集资诈骗罪需另行起诉）；
     
   • 数额认定是否达到“排除合理怀疑”标准；
     
   • 是否侵犯被告人诉讼权利（如未提前告知导致辩护准备不足）。
     若法院认定变更违法，可能维持原起诉或建议检察机关撤回起诉。

实务建议：若您作为被告人或辩护人遇到此类情况，需立即：

1. 核对变更内容与在案证据的匹配性；
   
2. 书面申请法庭给予合理辩护准备时间；
   
3. 重点审查数额计算的逻辑链条（如是否重复计算、是否扣除合法部分）。
   

如有具体案情或证据材料需要分析，可直接向我提供细节，我将结合类案判决进一步解答。