未经批准设立的医疗机构将面临行政处罚和可能的刑事处罚，具体如下：
一、行政处罚
取缔与没收：
- 根据《中华人民共和国医师法》第五十九条（原《执业医师法》第三十九条，相关条款精神延续），未经批准擅自开办医疗机构行医的，由县级以上人民政府卫生健康主管部门予以取缔，没收其违法所得及其药品、医疗器械。
罚款：
- 违法所得二倍以上十倍以下的罚款，若违法所得不足一万元的，按一万元计算。这一规定确保了罚款的严厉性，即使违法所得较少，也能起到足够的惩戒作用。
吊销执业证书：
- 对于医师而言，如果未经批准擅自开办医疗机构行医，除了上述处罚外，还可能被吊销其执业证书，这是对其执业资格的剥夺，意味着其将无法再从事医疗活动。
赔偿责任：
- 如果给患者造成损害的，依法承担赔偿责任。这是民事责任方面的规定，确保了患者的合法权益得到保障。
二、刑事处罚
非法行医罪：
- 根据《中华人民共和国刑法》第三百三十六条，未取得医生执业资格的人非法行医，情节严重的，可能面临三年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处或者单处罚金的刑事处罚。
严重损害就诊人身体健康：
- 如果非法行医行为严重损害了就诊人的身体健康，那么可能处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金。这一规定体现了对严重非法行医行为的严厉打击。
造成就诊人死亡：
- 若非法行医行为造成就诊人死亡，处十年以上有期徒刑，并处罚金。这是最为严厉的刑事处罚，体现了法律对生命权的尊重和保护。
三、实际案例与法律适用
- 在实际案例中，卫生健康主管部门会依法进行调查取证，确认违法事实后，会依据上述法律法规对未经批准设立的医疗机构进行处罚。如果违法行为涉嫌犯罪，还会移送司法机关追究刑事责任。
总结与建议：
未经批准设立医疗机构是严重的违法行为，不仅可能面临严厉的行政处罚，还可能构成犯罪，受到刑事处罚。因此，建议任何单位或个人在设立医疗机构前，务必依法办理相关手续，确保合法合规经营。如果遇到相关法律问题或纠纷，可以直接向我咨询，我将根据具体情况提供专业的法律意见和帮助。