工程项目通过商贸公司返还货款是否合法，需分情况讨论：
若商贸公司参与合同关系且符合合同约定与法律规定
- 若工程项目合同中明确约定了通过商贸公司进行货款返还的条款，且该条款不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，那么这种操作是合法的。例如，合同双方可能基于商业策略、税务筹划或资金流转的考虑，约定由商贸公司作为中间方进行货款的收付。在此情况下，商贸公司的参与是合同履行的一部分，其返还货款的行为具有合法性。
若商贸公司未参与合同关系或操作违反法律规定
- 若商贸公司并非工程项目合同的当事人，且未经合同双方同意擅自参与货款返还，这种行为可能涉嫌违法。特别是当商贸公司的参与导致合同款项的流转违反了金融管理、税务管理等相关法律法规时，如涉嫌洗钱、逃税等违法行为，那么这种操作显然是不合法的。
- 此外，如果工程项目合同中明确禁止通过第三方进行货款返还，或者双方未就此达成一致意见，而一方擅自通过商贸公司进行货款返还，这也可能构成违约行为，需要承担相应的违约责任。
法律建议：
- 在进行工程项目货款返还时，应严格遵守合同约定和法律规定。如果合同中有关于货款返还的明确条款，应按照条款执行；如果合同中没有相关条款或条款不明确，应与合同对方协商一致后再进行操作。
- 避免通过非合同当事人或未经授权的第三方进行货款返还，以防止涉嫌违法或违约行为。
- 如果对货款返还的合法性存在疑问，建议及时咨询专业律师或相关机构，以确保操作合法合规。
可能的法律后果：
- 如果通过商贸公司返还货款的行为被认定为违法或违约，可能会面临法律制裁或承担违约责任，包括但不限于罚款、赔偿损失、解除合同等。
- 在严重情况下，如果涉及洗钱、逃税等违法行为，还可能面临刑事责任的追究。
因此，在进行工程项目货款返还时，务必谨慎操作，确保合法合规。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。