结论前置：
- 若原合同有明确约定续签方式且未违反法律强制性规定，两年后补签纸质合同可能有效，但需承担一定风险。
- 若原合同无明确约定或补签行为违反法律强制性规定，补签合同可能无效或部分无效。
法律背景与详细分析：
首先，我们需要明确的是，合同的形式（包括书面形式、口头形式或其他形式）在法律上并非绝对固定，但某些特定类型的合同，根据法律规定或当事人之间的约定，可能需要采用书面形式。在劳动合同领域，虽然《劳动合同法》并未明确规定每次续签都必须采用书面形式，但为了保障双方权益，明确工作内容、条件、期限等关键信息，书面形式通常被视为更为稳妥和明确的方式。
针对您的情况，我们可以从以下几个角度进行分析：
原合同是否有明确约定：
- 如果原劳动合同中明确约定了续签的方式（包括是否需要书面形式），那么双方应当遵循该约定。若原合同未明确约定，则双方可以协商确定续签方式。
- 若原合同有约定且未违反法律强制性规定，两年后补签纸质合同，在双方自愿、平等、公平的基础上，可能被视为对原合同续签条款的履行或变更，从而具有法律效力。但需注意，补签时间过长可能引发对合同真实性和履行情况的争议。
补签行为是否违反法律强制性规定：
- 根据《劳动合同法》等相关法律法规，某些情况下劳动合同的签订或续签可能受到特定限制或要求。例如，连续订立二次固定期限劳动合同后，若劳动者提出或同意续订、订立无固定期限劳动合同的，用人单位应当与之订立。
- 如果补签行为违反了这些强制性规定，那么补签的合同可能无效或部分无效。例如，若在应订立无固定期限劳动合同的情况下，用人单位仍要求订立固定期限劳动合同并补签，该部分条款可能无效。
补签合同的法律后果：
- 补签合同后，双方应按照合同约定履行各自义务。若因补签时间过长导致合同履行出现争议（如工资调整、职位变动等），可能需要根据实际情况和合同约定进行协商或诉讼解决。
- 此外，补签合同并不意味着可以完全规避之前未签订书面合同可能带来的法律风险。例如，若在未签订书面合同期间发生劳动争议，劳动者仍可能依据相关法律法规主张权益。
法律建议：
- 及时补签：尽管两年后补签可能存在一定的法律风险，但相较于完全未签订书面合同的情况，补签仍然是一种更为稳妥的做法。建议双方尽快就续签事宜进行协商并签订书面合同。
- 明确条款：在补签合同时，应明确合同期限、工作内容、工作地点、工资待遇等关键条款，以避免未来可能出现的争议。
- 咨询专业律师：由于劳动合同法律关系复杂且涉及双方重大权益，建议在补签合同前咨询专业律师的意见，以确保合同的合法性和有效性。
可能面临的法律后果：
- 若补签合同被认定为无效或部分无效，双方可能需要根据实际情况重新协商合同条款或承担相应的法律责任。
- 若因补签时间过长导致合同履行出现争议且无法协商解决，双方可能需要通过诉讼或仲裁等方式解决争议。
最后，建议您在处理此类问题时保持谨慎态度，并尽快与对方协商补签事宜。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。