被纪检部门立案调查但尚未调查结束期间被调查人死亡的，案件处理方式需结合具体情形，一般分以下两种情况：

1. 若案件不涉及刑事犯罪，仅涉及违纪违法
   根据《中国共产党纪律检查机关案件检查工作条例》及相关党内法规，被调查人死亡的，纪检部门通常应终止调查程序，不再继续追究其纪律责任。但需注意两点：
   

• 已查实的违纪所得处理：若调查中已确认被调查人存在违纪所得（如受贿财物、违规收益等），纪检部门可依据《中国共产党纪律处分条例》第四十条，通过其家属或相关单位收缴违纪所得。
  
• 对涉案财物的处理：若被调查人死亡后，其名下财产与违纪行为直接相关（如用赃款购买的房产、车辆等），纪检部门可协调司法机关或相关单位，依法对涉案财物进行查封、扣押或没收。

1. 若案件涉嫌刑事犯罪，需移送司法机关处理
   根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第十六条，犯罪嫌疑人死亡的，公安机关、检察机关应撤销案件或终止侦查，不再追究刑事责任。但需区分以下情形：
   

• 已查实的犯罪所得处理：若调查中已确认被调查人存在犯罪所得（如受贿款、贪污款等），司法机关可依据《刑法》第六十四条，通过其家属或相关单位追缴违法所得。
  
• 对涉案财物的处理：若被调查人死亡后，其名下财产与犯罪行为直接相关（如用赃款购买的房产、车辆等），司法机关可依法对涉案财物进行查封、扣押或没收，并上缴国库。
  
• 对共同犯罪的处理：若案件涉及共同犯罪（如与他人合谋受贿、贪污），其他共犯仍需承担刑事责任，调查程序不会因被调查人死亡而终止。

实务建议：

• 若您是被调查人家属，可主动联系纪检部门或司法机关，了解案件进展及涉案财物处理情况，配合提供相关证据或材料。
  
• 若您认为案件处理存在争议（如涉案财物认定错误、程序违法等），可依法申请复议或提起申诉，但需在法定期限内提出。
  

如有进一步疑问，可直接向我咨询，我将结合具体案情为您提供详细解答。