在贷款合同纠纷中，法院确实有义务对合同的合法性进行审查，但这一审查通常是在当事人提出相关主张或抗辩后进行的，而非法院主动依职权全面调查。以下从不同角度对此问题进行详细分析：

1. 法院审查合同合法性的基本原则

法院在审理合同纠纷时，会遵循“不告不理”的原则，即法院不会主动对合同的合法性进行全面调查，除非当事人提出了相关主张或抗辩。例如，如果一方当事人主张合同存在无效情形（如违反法律、行政法规的强制性规定，或恶意串通损害国家、集体或第三人利益等），法院则会对此进行审查。

2. 当事人主张合同无效的情形

• 违反法律、行政法规的强制性规定：如果合同内容违反了法律、行政法规的强制性规定，那么该合同可能被认定为无效。在此情况下，当事人可以提出合同无效的主张，法院则会对此进行审查。
• 恶意串通损害他人利益：如果合同是双方恶意串通，损害国家、集体或第三人利益的，那么该合同同样可能被认定为无效。当事人也可以就此提出主张，并要求法院进行审查。
• 其他无效情形：如合同以合法形式掩盖非法目的，或者损害社会公共利益等，也可能导致合同无效。当事人可以根据具体情况提出相应主张。

3. 法院审查合同合法性的方式

• 听取双方陈述和辩论：法院会听取双方当事人的陈述和辩论，了解合同签订的背景、目的和过程，以及双方对合同合法性的看法。
• 审查相关证据：法院会要求双方当事人提供与合同合法性相关的证据，如合同文本、签订合同时的相关文件、交易记录等，并进行审查。
• 依据法律规定进行判断：法院会根据相关法律规定，对合同的合法性进行判断。如果合同存在无效情形，法院会依法认定合同无效。

4. 当事人应如何维护自己的权益

• 及时提出主张：如果当事人认为合同存在无效情形，应及时向法院提出主张，并提供相关证据。
• 积极参与诉讼：当事人应积极参与诉讼过程，听取法院的审查意见，并就合同合法性问题进行充分辩论。
• 寻求专业法律帮助：由于合同纠纷涉及复杂的法律问题，当事人可以寻求专业律师的帮助，以更好地维护自己的权益。

5. 可能的法律后果

• 合同被认定无效：如果法院认定合同存在无效情形，那么该合同将被视为自始没有法律约束力。双方当事人应返还因合同取得的财产，不能返还或没有必要返还的，应当折价补偿。有过错的一方应当赔偿对方因此所受到的损失；双方都有过错的，应当各自承担相应的责任。
• 合同被认定有效：如果法院认定合同不存在无效情形，那么该合同将继续具有法律约束力。双方当事人应按照合同约定履行各自的义务。

总结来说，在贷款合同纠纷中，法院有义务对合同的合法性进行审查，但这一审查通常是在当事人提出相关主张或抗辩后进行的。因此，当事人在涉及贷款合同纠纷时，应及时提出自己的主张，并提供相关证据，以维护自己的合法权益。如果您在贷款合同纠纷中遇到任何问题，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。