结算款超过合同约定金额时，超出部分能否仲裁需分情况讨论，具体结论及分析如下：

一、合同有明确约定时的处理

1. 若合同中存在价格调整条款
   例如合同约定“因工程量变更、原材料价格波动等情形可调整价款”，且超出部分符合调整条件，则应按合同约定执行。此时超出部分属于合同范围内的合理调整，双方应遵循约定程序结算，无需通过仲裁解决。

2. 若合同中存在争议解决条款（如仲裁条款）
   即使超出部分因合同调整产生，若双方对调整结果存在争议（如对工程量变更的认定、价格调整的计算方式有分歧），仍可依据合同中的仲裁条款申请仲裁。仲裁机构将根据合同约定及实际证据裁决超出部分的合法性及金额。

二、合同无明确约定时的处理

1. 双方协商一致
   若合同未约定价格调整或争议解决方式，双方可协商确定超出部分的结算方式（如签订补充协议）。协商过程中，建议以书面形式明确超出原因、计算依据及支付时间，避免后续纠纷。

2. 协商不成时的仲裁或诉讼
   若协商未果，双方可根据合同中的争议解决条款选择仲裁或诉讼。例如：

   • 因一方违约导致超出：如施工方未按合同标准施工导致成本增加，违约方应承担超出部分。
   • 因不可抗力或业主原因导致超出：如原材料价格大幅上涨、设计变更等，双方可重新协商价格或按公平原则分担损失。
   • 争议无法解决时：仲裁机构或法院将根据实际证据（如工程变更指令、市场价格数据等）裁决超出部分的责任归属及金额。

三、关键操作步骤

1. 核查合同条款
   重点检查价格调整条款、变更程序条款及争议解决条款，明确合同对超出部分的处理规则。

2. 收集证据
   根据超出原因收集证据，例如：

   • 工程量增加：工程变更指令、施工图纸修改记录。
   • 价格上涨：市场价格数据、采购合同。
   • 不可抗力：政府文件、自然灾害证明。

3. 协商或申请仲裁/诉讼

   • 优先通过协商或补充协议解决。
   • 若协商无果，及时委托律师发送律师函，明确立场及要求。
   • 仍无法解决时，依据合同约定申请仲裁或提起诉讼。

四、风险提示

1. 未经审批的变更可能无效
   若超出部分因合同变更产生，但未遵循合同约定的变更审批程序（如未取得业主书面确认），可能导致超出部分无法结算。

2. 证据不足的风险
   若无法提供充分证据证明超出原因（如工程量增加、价格上涨），可能承担不利后果。

3. 行业惯例的参考作用
   在合同无明确约定时，行业惯例（如建设工程领域的计价规范）可能作为裁决参考，但需结合具体案情判断。

建议：若您遇到结算款超出合同金额的问题，建议先核查合同条款，收集相关证据，并尝试与对方协商。若协商无果，可委托律师介入，通过仲裁或诉讼维护合法权益。如有进一步疑问，可直接向我咨询。