当营运车辆被撞且双方都有责任时，赔偿问题需要根据事故责任的具体划分以及相关法律法规来综合确定。以下是一个清晰、详细且有深度的解答：
一、赔偿原则
在双方都有责任的情况下，赔偿通常遵循“按责赔偿”的原则。即根据双方在事故中所占的责任比例，来分担相应的赔偿责任。
二、赔偿项目
对于营运车辆而言，赔偿项目可能包括以下几个方面：
车辆维修费用：
- 双方需根据各自的责任比例，承担营运车辆因事故受损的维修费用，包括零部件更换、工时费等。
停运损失：
- 营运车辆因事故停运期间，会产生合理的经济损失，如因停运而减少的营业收入等。这部分损失也应根据双方的责任比例进行分担。
- 营运方需提供相关的营运证明文件，如营业执照、营运合同、停运期间的收入证明等，以证明损失的合理性。
车上货物损失（如适用）：
- 如果车上载有货物且因事故受损，双方也需根据责任比例赔偿货物的损失价值。
其他合理费用：
- 如拖车费、车辆保管费、处理事故过程中的合理交通费用等，也应根据双方的责任比例进行分担。
三、赔偿流程
确定责任比例：
- 首先，需要由交警部门或相关机构出具事故责任认定书，明确双方在事故中所占的责任比例。
收集证据：
- 营运方需收集并保留好与赔偿相关的所有证据，如维修发票、停运证明、货物损失证明、交通费用凭证等。
协商赔偿：
- 双方可以根据责任比例和赔偿项目，进行协商并达成赔偿协议。
诉讼解决（如协商不成）：
- 如果双方无法就赔偿问题达成一致，可以通过法律途径解决，如向法院提起诉讼。
四、注意事项
及时报案：
- 事故发生后，营运方应及时向保险公司报案，并按照保险公司的要求提供相关证据和资料。
保留证据：
- 营运方需确保所有与赔偿相关的证据都得到妥善保留，以便在协商或诉讼过程中提供有力支持。
了解保险条款：
- 营运方应了解自己所购买的保险条款，特别是关于赔偿范围、免赔额等方面的规定，以便在索赔时做到心中有数。
综上所述，当营运车辆被撞且双方都有责任时，赔偿问题需要根据事故责任的具体划分以及相关法律法规来综合确定。双方应本着公平、合理的原则进行协商，并在必要时通过法律途径解决争议。