档案不在公司，并不意味着可以直接离职而不顾及法律程序和后果。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
一、法律规定办理离职的期限
根据《劳动合同法》的相关规定，劳动者提前三十日以书面形式通知用人单位，可以解除劳动合同。在试用期内，劳动者则需提前三日通知用人单位。这一规定明确了劳动者离职的法定程序和期限，与档案是否在公司无直接关联。因此，即使档案不在公司，劳动者也需遵循这一法定程序，不能直接离职。
二、直接离职可能面对的后果
法律追责：如果劳动者未按照法定程序办理离职手续，用人单位有权按照法律程序对劳动者进行追责。这包括但不限于要求劳动者赔偿因未提前通知而造成的损失。
影响切身利益：档案不在公司，但社保、公积金、企业年金、当月工资等仍涉及到劳动者的切身利益。如果劳动者直接离职，可能会在与用人单位协商解决这些事宜时遇到阻碍。
职业污点：在领导没有批准辞职信的情况下，劳动者在规定时间到期之前离开，可能形成违约行为。有些企业会在员工离职证明上做一些手脚，让劳动者在职业道路上增添违约失信的污点，对今后找工作和职业发展产生一定影响。
三、档案与离职的关系
档案是否在公司与能否直接离职无直接关联。档案是劳动者个人历史和工作经历的记录，而离职是劳动者与用人单位之间劳动关系的解除。两者虽然可能涉及同一用人单位，但属于不同的法律关系和程序。因此，不能以档案不在公司为由，直接离职而不顾及法律程序和后果。
四、建议与措施
遵循法定程序：劳动者应按照《劳动合同法》的规定，提前通知用人单位并办理离职手续。这是保障自身权益和避免法律纠纷的重要措施。
与用人单位协商：在离职过程中，劳动者应与用人单位积极协商，解决社保、公积金、企业年金、当月工资等切身利益问题。这有助于维护劳动者的合法权益和避免不必要的纠纷。
保留相关证据：劳动者在离职过程中应保留好相关证据，如辞职信、离职证明、工资单等。这些证据在后续可能出现的法律纠纷中具有重要的证明作用。
综上所述，档案不在公司并不意味着可以直接离职而不顾及法律程序和后果。劳动者应遵循法定程序办理离职手续，并与用人单位积极协商解决切身利益问题。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。