结论前置：在商业用房过户合同中，关于过户手续费用由乙方承担的约定，需明确费用范围、支付方式、违约责任等关键条款，以确保合同的有效性和可执行性。以下为具体约定建议：

1. 明确费用范围：

   • 合同中应详细列明乙方需承担的过户手续费用，包括但不限于契税、印花税、登记费、评估费、中介服务费（如有）等。
   • 示例条款：“乙方同意承担本次商业用房过户过程中产生的全部税费及费用，包括但不限于契税、印花税、房屋登记费、土地登记费、评估费及中介服务费（如有）等。”

2. 支付方式与时间：

   • 约定乙方支付过户费用的具体方式（如一次性支付、分期支付）及支付时间节点（如合同签订后X日内、过户手续办理前等）。
   • 示例条款：“乙方应于本合同签订之日起X日内，将上述过户费用一次性支付至甲方指定账户，或按双方约定的分期支付计划执行。”

3. 违约责任：

   • 明确若乙方未按约定支付过户费用，应承担的违约责任，包括但不限于支付违约金、赔偿甲方因此遭受的损失等。
   • 示例条款：“若乙方未按本合同约定时间支付过户费用，每逾期一日，应按未支付金额的X%向甲方支付违约金；逾期超过X日的，甲方有权解除本合同，并要求乙方赔偿因此造成的全部损失。”

4. 费用调整机制（可选）：

   • 考虑到税费政策可能调整，合同中可约定费用调整机制，明确在税费政策变化时，双方如何协商调整过户费用。
   • 示例条款：“如因国家税费政策调整导致过户费用发生变化，双方应友好协商，根据新的税费政策调整过户费用，并签订补充协议。”

5. 其他约定：

   • 还可根据实际情况，在合同中约定其他与过户费用相关的条款，如费用发票的开具、费用的结算与退还等。
   • 示例条款：“甲方应在收到乙方支付的过户费用后X日内，向乙方提供合法有效的费用发票。如因甲方原因导致发票无法开具或开具错误，甲方应承担相应责任。”

特别提醒：在签订商业用房过户合同时，双方应充分了解并协商确定过户费用的承担方式，确保合同条款的明确性和可执行性。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。