遇到保险公司合作的医院不再垫付医疗费用的情况，确实会让人感到困扰。不过，别担心，我们可以按照以下步骤来处理这个问题：

首先，确认保险条款： 你需要仔细查阅你的保险合同，特别是关于医疗费用垫付的相关条款。看看合同中是否明确规定了保险公司在特定情况下有义务垫付医疗款项。这是后续行动的重要依据。

接下来，搜集相关证据： 如果合同中确实有这样的规定，但保险公司未能履行，那么你需要开始搜集相关证据。这些证据包括但不限于：事故责任认定书（如果有的话）、医疗费用明细表、保险合同复印件等。这些证据将帮助你证明保险公司的违约行为。

然后，向保险公司发出正式通知： 在搜集好证据后，你可以向保险公司发出正式通知。在通知中，详细阐述保险公司的违约行为，即未按照合同规定垫付医疗款项，并提出你的垫付请求。要求保险公司在一定期限内给予答复并履行垫付义务。

如果保险公司依然拒绝垫付，你可以考虑向保险监管机构投诉： 保险监管机构是负责监督保险公司行为的机构。你可以向他们投诉保险公司的违约行为，并提供你搜集到的所有证据。监管部门将会展开调查，并敦促保险公司妥善处理问题。

最后，作为备选方案，你可以考虑通过法律诉讼来解决问题： 如果以上方法都未能解决问题，你可以选择向法院提起民事诉讼，要求保险公司承担相应的垫付责任。不过，需要注意的是，诉讼过程可能较为漫长且成本较高。因此，在决定之前，请务必慎重考虑，并咨询专业律师的意见。

希望这些建议能对你有所帮助。在处理这类问题时，保持冷静和理性是非常重要的。如果你需要进一步的帮助或咨询，请随时告诉我。