关于您提出的“商人解除留置手续的流程已经启动，案件是否已经查清楚”的问题，这实际上涉及两个层面的内容：一是解除留置手续的流程，二是案件的调查进展。

首先，解除留置手续的启动，并不直接等同于案件已经查清楚。留置措施是监察机关在调查过程中，对涉嫌严重职务违法或职务犯罪的被调查人采取的一种限制人身自由的措施。当监察机关认为留置的必要性已经消失，或者被调查人已经配合调查且没有继续留置的必要，或者留置期限已经届满时，会启动解除留置手续。这一流程的启动，更多是基于留置措施本身的必要性和时效性考虑，而非案件调查的最终结论。

其次，案件是否查清楚，取决于监察机关对案件事实的调查程度和对证据的收集情况。监察机关在调查过程中，会依法收集、固定、审查和运用证据，以查明案件事实。只有当监察机关认为已经掌握了足够的证据，能够证明被调查人的违法或犯罪行为，且案件事实已经清楚、证据确实充分时，才会作出相应的处理决定，如移送检察机关审查起诉等。

因此，解除留置手续的启动，并不直接说明案件已经查清楚。案件的调查进展和最终结论，需要依据监察机关的调查结果和证据情况来判断。如果您作为当事人或相关方，对案件的调查进展有疑问或需要了解更多信息，建议与监察机关或相关办案部门进行沟通，以获取更准确和详细的信息。