员工未满三个月自动离职，一般情况下是没有经济补偿的，但具体还需根据离职原因和合同约定来判断。以下是对这一问题的详细分析：
一、自动离职无补偿的一般情况
在试用期内（一般三个月以内），如果劳动者自己主动离职，且用人单位不存在法定过错情形，如未按时足额支付劳动报酬、未提供劳动保护或劳动条件、未依法缴纳社会保险费等，那么劳动者通常是无法获得经济补偿的。这是因为，自动离职是劳动者单方面的行为，用人单位并未违反劳动合同或相关法律法规，因此没有义务支付经济补偿。
二、可能获得补偿的特殊情况
用人单位存在过错：
- 如果用人单位存在未按时足额支付劳动报酬、未提供劳动保护或劳动条件、未依法缴纳社会保险费等违法行为，劳动者以此为由自动离职的，有权要求用人单位支付经济补偿。
- 经济补偿的标准按照劳动者在本单位工作的年限计算，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。
合同具体约定：
- 劳动合同中可能包含关于离职补偿的特定条款。如果合同中有明确规定，在特定情况下劳动者自动离职可以获得补偿，那么应当按照合同约定执行。
三、离职手续和费用结清
- 无论劳动者是否获得经济补偿，用人单位都应当为其办理好离职手续，并结清工资等费用。这是用人单位的基本义务，也是保障劳动者权益的重要措施。
- 如果双方因离职补偿等问题产生争议，劳动者可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，通过合法的途径来解决问题。
四、建议与注意事项
梳理离职原因：
- 劳动者在决定自动离职前，应当仔细梳理离职原因，明确是否存在用人单位过错或合同约定等可能获得补偿的情形。
收集相关证据：
- 如果劳动者认为存在获得补偿的情形，应当及时收集好工作证、工资条、劳动合同等相关证据，以便在需要时维护自身权益。
友好沟通协商：
- 在离职过程中，劳动者应当与用人单位进行友好沟通协商，尽量达成一致意见。如果无法协商解决，再考虑通过法律途径来维护自身权益。
举例说明：假设某员工在试用期内工作了一个半月后决定自动离职，且用人单位不存在任何过错情形。那么，该员工通常是无法获得经济补偿的。但是，如果该员工能够证明用人单位存在未按时足额支付劳动报酬等违法行为，那么他就有权要求用人单位支付经济补偿。
综上所述，员工未满三个月自动离职是否有补偿需根据具体情况来判断。如果您对此有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。