针对国有土地上房屋征收与补偿纠纷，应通过行政诉讼解决，而非民事诉讼。以下从法律性质、诉讼类型对比及典型案例三个角度展开分析：

一、法律性质决定诉讼类型：行政机关为被告时适用行政诉讼

根据《国有土地上房屋征收与补偿条例》第十四条、第二十六条，被征收人对市、县级人民政府作出的房屋征收决定或补偿决定不服的，可依法申请行政复议或提起行政诉讼。核心逻辑在于：征收行为的实施主体是国家行政机关（如市、县级人民政府或其指定的房屋征收部门），其行使的是公权力，因此引发的纠纷属于行政法律关系。

例如，若房屋征收部门未与被征收人达成补偿协议，直接报请政府作出补偿决定，被征收人对该决定不服的，只能通过行政诉讼或行政复议维权，不能提起民事诉讼。

二、民事诉讼与行政诉讼的核心区别：主体、目的与举证责任

1. 诉讼主体不同
   行政诉讼中，被告恒定为行政机关（如房屋征收部门），原告为公民、法人或其他组织；民事诉讼中，双方当事人地位平等，可互为原、被告。

2. 诉讼目的不同
   行政诉讼旨在监督行政机关依法行使职权，保护公民合法权益；民事诉讼解决平等主体间的财产或人身关系纠纷。

3. 举证责任不同
   行政诉讼中，由被告（行政机关）承担举证责任，需证明其行政行为的合法性；民事诉讼中，遵循“谁主张，谁举证”原则。

典型场景：若被征收人认为补偿标准过低，起诉房屋征收部门要求提高补偿，此时被告为行政机关，应通过行政诉讼解决，且由行政机关举证证明补偿标准的合法性。

三、公报案例解析：行政协议纠纷的调解与司法温度

以“赖某诉某市国有土地上房屋征收与补偿管理办公室房屋征收补偿协议案”为例：

• 案情：赖某通过民事判决确认对涉案房屋的所有权，但房屋征收部门与赖某的继父辛某签订了补偿协议。赖某起诉要求撤销协议并重新签订。
• 处理结果：一审法院判决确认赖某为被征收人，同时保障辛某的居住权；二审法院通过调解，促成三方达成协议：房屋征收部门与赖某重新签订补偿协议，并办理辛某的居住权登记。
• 典型意义：本案属于行政协议纠纷（行政机关与公民签订的补偿协议），通过行政诉讼解决。法院在审查协议合法性的同时，兼顾家庭成员间的居住权需求，体现了行政诉讼在化解社会矛盾中的积极作用。

四、实务建议：如何正确启动行政诉讼？

1. 明确被告与诉讼请求
   被告为作出征收决定或补偿决定的行政机关（如市、县级人民政府或房屋征收部门）；诉讼请求可包括撤销违法决定、要求重新作出补偿决定等。

2. 准备关键证据
   需提供房屋权属证明、征收决定或补偿决定文件、沟通记录等，证明行政行为违法或补偿不公。

3. 注意起诉期限
   根据《行政诉讼法》，公民、法人或其他组织直接向人民法院提起诉讼的，应当自知道或应当知道作出行政行为之日起六个月内提出。

总结：国有土地上房屋征收与补偿纠纷属于行政诉讼范畴，核心原因在于被告为行政机关且行使公权力。若您遇到此类问题，可携带相关材料向我咨询，我将结合具体案情提供法律方案。