特种设备在被查封且不再使用的情况下，是否可以申请拆除，需视具体情况而定，不能一概而论。以下是从不同角度进行的分析：
一、查封的法律效力与目的
查封是行政机关或司法机关为保障法律程序的顺利进行或保护相关权益，对特定财产采取的限制性措施。其目的在于确保财产在争议解决或法律程序结束前不被擅自处分或转移。因此，在查封期间，被查封的设备原则上应保持原状，不得擅自拆除或处置，除非得到查封机关的明确许可。
二、申请拆除的合法途径
与查封机关沟通：
- 若特种设备因查封而长期闲置，且确实不再需要使用，首先应与查封机关（如市场监督管理局、法院等）进行沟通，说明情况并申请解除查封或允许拆除。
- 查封机关会根据具体情况，如查封原因是否已消除、设备是否涉及其他法律纠纷等，来决定是否同意拆除。
提供充分证据：
- 在申请拆除时，应提供充分的证据证明设备已不再使用，且拆除不会影响查封目的的实现。
- 证据可能包括设备停用记录、相关维修或报废证明、以及查封原因已消除的证明等。
遵循法定程序：
- 若查封机关同意拆除，应遵循其指定的程序进行，如办理相关手续、确保拆除过程的安全等。
- 若查封机关不同意拆除，则不得擅自行动，否则可能面临法律责任。
三、擅自拆除的法律后果
- 行政责任：擅自拆除被查封的特种设备，可能违反《中华人民共和国行政强制法》等相关法律法规，面临行政机关的处罚，如罚款、没收违法所得等。
- 刑事责任：在极端情况下，若擅自拆除行为构成犯罪（如破坏生产经营罪、妨害公务罪等），还可能承担刑事责任。
- 民事责任：若擅自拆除行为导致他人权益受损，还可能承担民事赔偿责任。
四、特殊情况下的处理
- 设备自然损坏或无法修复：若特种设备因自然原因或长期闲置而损坏，且无法修复或修复成本过高，可与查封机关协商处理，如申请报废或变卖残值。
- 查封原因已消除：若查封原因已消除（如相关纠纷已解决、罚款已缴纳等），可及时向查封机关申请解除查封，并询问是否可以拆除设备。
建议：在特种设备被查封且不再使用的情况下，应首先与查封机关沟通并申请解除查封或允许拆除。在得到明确许可前，不得擅自拆除设备。若遇到复杂情况或法律纠纷，建议及时咨询专业律师以获取更具体的法律建议。如有任何法律问题，都可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律帮助。