中标单位在被质疑期间，其投标保证金是可以退还的，但具体退还情况需依据相关法律法规及招标文件的规定来确定。以下是从不同角度对此问题的详细分析：

一、法律法规依据

根据《中华人民共和国招标投标法实施条例》第五十七条的规定，招标人最迟应当在书面合同签订后5日内向中标人和未中标的投标人退还投标保证金及银行同期存款利息。这一条款明确了投标保证金退还的时间节点，即书面合同签订后5日内，且并未将“被质疑期间”作为不退还保证金的法定情形。因此，从法律法规的角度来看，中标单位在被质疑期间，其投标保证金仍应按照法律规定进行退还。

二、招标文件规定

除了法律法规外，招标文件也可能对投标保证金的退还作出具体规定。这些规定可能涉及退还的条件、流程、时间等。因此，中标单位在被质疑期间能否退还保证金，还需仔细查阅招标文件的相关规定。如果招标文件中有明确规定在被质疑期间不退还保证金，那么中标单位可能需要等待质疑期结束后才能申请退还。但这种情况并不常见，且需与法律法规保持一致。

三、实际操作建议

1. 查阅招标文件：中标单位应首先查阅招标文件，了解其中关于投标保证金退还的具体规定。如果招标文件中有明确规定，则按照规定执行。

2. 与招标人沟通：如果招标文件未明确规定或规定不明确，中标单位可以与招标人进行沟通，了解招标人对被质疑期间投标保证金退还的态度和做法。

3. 关注质疑期进展：中标单位应密切关注质疑期的进展，确保在质疑期结束后及时申请退还保证金。如果质疑期延长或出现其他特殊情况，中标单位应及时与招标人沟通并调整退还计划。

4. 保留相关证据：中标单位在申请退还保证金时，应保留好相关证据，如投标保证金缴纳凭证、招标文件、质疑函等，以便在需要时提供证明。

四、可能面临的法律后果

如果招标人未按照法律法规或招标文件的规定退还中标单位的投标保证金，中标单位有权向相关部门投诉或寻求法律援助。招标人可能因此面临行政处罚或民事赔偿责任。

中标单位在被质疑期间其投标保证金是可以退还的，但具体退还情况需依据相关法律法规及招标文件的规定来确定。中标单位应仔细查阅招标文件、与招标人沟通、关注质疑期进展并保留好相关证据。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。