在建筑工程合同中，当违约损失超过定金时，处理方式主要依据《民法典》的相关规定，并结合实际情况进行综合判断。以下是对这一问题的详细解答：
一、定金与违约金的选择权
根据《民法典》的规定，当事人在合同中既约定了违约金，又约定了定金的，当一方违约时，对方有权选择适用违约金条款或者定金条款，但二者不能并用。这意味着，守约方需要根据自身损失情况，权衡选择哪种条款对自己更为有利。
二、选择违约金条款的处理
违约金调整：如果守约方选择适用违约金条款，而约定的违约金过分高于实际造成的损失，违约方有权请求法院或仲裁机构适当降低违约金数额。法院或仲裁机构在裁决时，会结合多种因素，如违约行为的性质、程度、给守约方造成的实际损失等，按照公平和诚信原则进行裁决。
额外损失赔偿：如果违约金不足以弥补守约方的实际损失，守约方还可以就不足部分要求违约方进行赔偿。这要求守约方能够提供充分的证据证明其实际损失。
三、选择定金条款的处理
定金罚则：如果守约方选择适用定金条款，根据定金罚则，收受定金的一方不履行债务或者履行债务不符合约定，致使不能实现合同目的的，应当双倍返还定金；给付定金的一方不履行债务或者履行债务不符合约定，致使不能实现合同目的的，无权请求返还定金。
超出定金部分的损失赔偿：若实际损失高于定金数额，守约方在选择定金条款后，定金不足以弥补损失的，可以请求违约方赔偿超出定金数额的损失。但同样，守约方需要对实际损失承担举证责任，若无法举证，则其主张可能难以得到支持。
四、综合考量与选择
在处理违约损失超过定金的情况时，守约方应综合考量自身损失、违约方的违约程度、合同的具体条款以及法律的相关规定等因素，合理选择对自己更有利的方式维权。如果违约金条款能够更充分地弥补损失，且违约方同意支付或法院/仲裁机构裁决支持，则可以选择违约金条款；如果定金罚则加上可能的额外损失赔偿能够更全面地保护守约方的利益，则可以选择定金条款。
五、实际操作建议
详细审查合同：在签订合同时，应详细审查合同中的违约金和定金条款，确保条款明确、合理。
保留证据：在合同履行过程中，应妥善保留与合同履行、违约行为相关的证据，以便在发生纠纷时能够充分证明自己的主张。
及时咨询专业人士：在处理复杂的合同纠纷时，建议及时咨询法律专业人士，以获取更专业、更准确的法律建议。
综上所述，当建筑工程合同中的违约损失超过定金时，守约方应根据自身损失情况和合同条款，合理选择违约金或定金条款进行维权，并注意保留相关证据和及时咨询专业人士。