损坏农作物赔偿一般不需要开发票，这种做法是合法的，但需根据具体情况确定赔偿依据和方式。具体分析如下：

1. 赔偿的性质决定了发票并非必要
   损坏农作物赔偿属于民事侵权赔偿范畴，核心是弥补受害方的实际损失，而非商业交易行为。根据《民法典》第1184条，赔偿金额应按照“损失发生时市场价格或其他合理方式计算”。因此，赔偿的依据是农作物的实际价值（如市场价、评估价），而非发票金额。

2. 发票的作用与局限性
   发票是商业交易中证明款项往来的凭证，但农作物种植通常为自产自销或非商业行为，可能未开具发票。若受害方能提供其他证据（如种植记录、收购合同、市场价证明等），同样可证明损失金额。发票并非唯一合法证据。

3. 特殊情况需注意
   若赔偿方要求以发票作为报销或财务处理依据（如企业赔偿），可协商要求受害方提供成本发票（如种子、化肥购买发票），但这是赔偿方的内部管理需求，不影响赔偿的合法性。若双方对赔偿金额有争议，可通过第三方评估机构确定损失，而非依赖发票。

建议：

• 保留农作物受损的证据（如照片、视频、鉴定报告）；
  
• 收集市场价或同类作物赔偿案例作为参考；
  
• 若协商不成，可向法院起诉，由法院委托评估机构确定损失金额。
  

如有进一步疑问，可直接向我咨询具体案件处理方式。