工厂的工资分两次发是否正常，需结合具体情况来判断。以下是从不同角度进行的分析：
合理情况
公司薪酬结构设计需要：
- 许多公司为了更科学地激励员工，会设计包含基本工资、绩效工资、奖金等多部分的复杂薪酬结构。基本工资通常每月固定发放，以保障员工的基本生活；而绩效工资则根据员工的工作表现和业绩考核结果在另一个时间发放，以紧密挂钩工作成果，提高工作效率和业绩。例如，销售公司可能将基本工资与绩效工资分别在不同时间点发放，这种安排既符合企业管理需求，也不违反法律规定。
特殊福利或补贴的发放安排：
- 公司除了常规工资外，还可能设有交通补贴、餐补、高温补贴等特殊福利。为了便于管理和核算，这些福利补贴可能会与工资分开发放，有利于企业对各项费用进行精准统计和管理。这种安排通常也是合理的，且符合实际的财务管理需求。
合同约定与法律规定：
- 只要单位在劳动合同或相关协议中明确约定了工资分两次发放的具体方式和时间，且该约定不违反最低工资标准等法律规定，即视为合理。根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十条，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。因此，只要合同有明确约定，且单位按时足额支付，工资分两次发是合法的。
不合理甚至违法情况
为了避税：
- 部分企业为降低员工个人所得税缴纳金额，将工资分两次通过不同方式发放（如公账与私人账户），这种行为属于偷税漏税，违反了税收法律法规。企业可能面临税务机关的处罚，包括追缴少缴税款、加收滞纳金以及可能的罚款等刑事处罚。此种做法还会损害员工的合法权益，如影响社保缴纳基数、公积金缴存额度及未来贷款额度等。
故意拖欠或克扣工资：
- 以分两次发放工资为借口，故意拖延其中一部分工资的发放时间或随意减少第二次发放的工资数额，构成拖欠或克扣工资的违法行为。根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠。员工有权要求企业足额支付工资，并可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，要求支付拖欠工资及相应的经济补偿。
法律建议
- 核实合同约定：首先，劳动者应核实自己与工厂签订的劳动合同中是否有关于工资分两次发放的明确约定。如果合同中有明确约定，且工厂按时足额支付了工资，那么这种发放方式就是合法的。
- 关注工资总额：无论工资是分一次还是两次发放，劳动者都应关注自己的工资总额是否达到了合同约定的标准，以及是否符合当地的最低工资标准。如果发现工资被克扣或拖欠，应及时向工厂提出异议，并保留相关证据。
- 依法维权：如果工厂存在拖欠或克扣工资的行为，劳动者可以依法向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，要求工厂支付拖欠的工资及相应的经济补偿。
总之，判断工厂工资分两次发是否正常，关键在于单位是否按时足额支付工资、是否在劳动合同或相关协议中有明确约定、以及是否遵守了最低工资标准等法律规定。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。