员工在病假期间不续签劳动合同是否合法，需视具体情况而定。以下从不同角度进行详细分析：
一、医疗期内的处理
法律规定：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十二条，劳动者患病或者非因工负伤，在规定的医疗期内，用人单位不得解除劳动合同。同时，根据第四十五条，劳动合同期满，若劳动者仍处于医疗期内，劳动合同应当续延至医疗期结束时终止。
合法性分析：
- 若用人单位在医疗期内不续签：这属于违法解除劳动合同。员工有权要求用人单位继续履行劳动合同，或者要求用人单位支付赔偿金（通常为经济补偿标准的二倍）。
- 若员工在医疗期内主动不续签：虽然法律未明确禁止，但员工应谨慎考虑，因为医疗期内员工享有特殊的劳动保护。若员工因个人原因决定不续签，建议与用人单位充分沟通，并确保了解相关法律后果。
二、医疗期届满后的处理
法律规定：
- 医疗期届满后，若员工能正常工作，用人单位应根据员工的工作表现和身体状况决定是否续签劳动合同。
- 若员工不能从事原工作，也不能从事由用人单位另行安排的工作，用人单位可以解除劳动合同，但需提前三十日以书面形式通知员工本人或者额外支付员工一个月工资，并支付经济补偿。
合法性分析：
- 若用人单位在医疗期届满后不续签，且员工能正常工作：这属于违法解除劳动合同，员工有权要求用人单位支付赔偿金或继续履行劳动合同。
- 若用人单位在医疗期届满后不续签，且员工不能从事原工作或另行安排的工作：用人单位可以解除劳动合同，但需依法支付经济补偿。经济补偿的计算方式通常为：按员工在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向员工支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，支付半个月工资的经济补偿。
三、员工应对措施与建议
了解医疗期时长：
- 员工应首先明确自己的医疗期时长，这通常根据员工的工作年限和在本单位工作年限确定。了解医疗期有助于员工判断用人单位的行为是否合法。
收集证据：
- 员工应妥善保存劳动合同、工资条、诊断证明、病假条等相关证据，以备后续维权之需。这些证据在劳动争议仲裁或诉讼中可能起到关键作用。
与公司沟通协商：
- 员工应尝试与公司进行沟通，说明法律规定，要求公司按照法律规定处理劳动合同事宜。沟通过程可通过书面形式进行，并保留好相关沟通记录。
寻求法律援助：
- 若公司拒绝协商或违反法律规定，员工可向当地的劳动监察部门投诉，或向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，甚至向人民法院提起诉讼。在必要时，员工可寻求专业律师的帮助，以更好地维护自身合法权益。
总结与提醒：员工在病假期间不续签劳动合同是否合法，取决于员工是否处于法定医疗期内以及用人单位和员工的具体行为。员工应充分了解自己的法律权益，并采取适当措施保护自身合法权益。同时，用人单位也应严格遵守相关法律法规，确保在处理员工劳动合同事宜时做到合法合规。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。