合同约定违约金按银行存款利率计算，在符合法律法规且不违背公平原则的情况下，通常是有效的。以下从不同角度为您详细分析：
一、合同约定的有效性
意思自治原则：根据《民法典》的相关规定，当事人有权在合同中自由约定违约金的数额或计算方式。只要这种约定不违反法律法规的强制性规定，不违背公序良俗，就应当被认定为有效。因此，如果合同中明确约定了违约金按银行存款利率计算，且该约定不违反上述原则，那么该约定就是有效的。
公平原则：虽然合同约定具有相对自由性，但违约金的约定也应当遵循公平原则。如果约定的违约金过低，可能无法起到惩罚违约方和补偿守约方损失的作用；如果约定的违约金过高，则可能违背公平原则，对违约方造成不合理的负担。不过，就您提出的情况而言，按银行存款利率计算违约金，通常不会过高到违背公平原则的程度。
二、可能面临的调整
法院或仲裁机构的调整权：根据《民法典》第五百八十五条的规定，如果约定的违约金低于造成的损失，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以增加；如果约定的违约金过分高于造成的损失，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以适当减少。因此，即使合同中约定了按银行存款利率计算违约金，如果实际损失与该约定存在显著差异，法院或仲裁机构也有权根据实际情况进行调整。
实际损失的考量：在判断违约金是否合理时，法院或仲裁机构会考虑实际损失的大小。如果按银行存款利率计算的违约金无法充分补偿守约方因违约行为所遭受的损失，那么法院或仲裁机构可能会根据实际损失情况对违约金进行调整。
三、建议与注意事项
仔细审查合同条款：在签订合同时，务必仔细审查合同中的违约金条款，确保其符合您的预期和利益。如果对违约金条款有疑问或不满，应及时与对方协商修改。
保留相关证据：在合同履行过程中，如果发生违约行为，应及时保留相关证据，如合同文本、付款记录、沟通记录等。这些证据在后续可能发生的纠纷解决中将起到重要作用。
寻求法律帮助：如果您对合同中的违约金条款或实际发生的违约行为有疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。我将根据您的具体情况提供专业的法律意见和解决方案。
举例说明：假设您与一家银行签订了一份贷款合同，合同中约定如果借款人提前还款，将按未还款金额的一定比例（如按银行存款利率计算）收取违约金。后来，您因故需要提前还款，但银行要求您支付的违约金远高于按银行存款利率计算的结果。在这种情况下，您可以首先审查合同条款，确认违约金的具体计算方式；然后，您可以与银行协商降低违约金；如果协商无果，您可以考虑通过法律途径解决纠纷，如向法院提起诉讼或向仲裁机构申请仲裁。在诉讼或仲裁过程中，法院或仲裁机构将根据合同约定、实际损失情况以及公平原则等因素对违约金进行调整。