核心结论：甲方私自取走乙方备案文档，乙方可根据具体情况采取协商、投诉举报、民事诉讼或刑事控告等措施来维护自身权益。以下是具体分析：

1. 协商解决：

   • 前提：若双方关系尚可，且甲方取走文档的行为可能出于误解或疏忽。
   • 措施：乙方可首先尝试与甲方进行友好协商，明确要求甲方归还备案文档，并解释该行为可能带来的法律后果。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》中关于物权保护的规定，乙方作为文档的所有者或合法持有者，有权要求甲方返还。

2. 投诉举报：

   • 前提：若甲方拒绝归还，且该行为可能涉及违反行业规定或公司内部管理制度。
   • 措施：乙方可以向相关行业主管部门或甲方所在单位进行投诉举报，要求对甲方的行为进行调查和处理。
   • 法律依据：根据行业规定或公司内部管理制度，甲方可能因私自取走他人文档而受到纪律处分或行政处罚。

3. 民事诉讼：

   • 前提：若甲方行为构成侵权，且协商、投诉均无果。
   • 措施：乙方可以向人民法院提起民事诉讼，要求甲方承担侵权责任，包括返还文档、赔偿损失等。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》中关于侵权责任的规定，甲方私自取走乙方备案文档，侵犯了乙方的物权，应当承担相应的民事责任。

4. 刑事控告（如适用）：

   • 前提：若甲方行为涉嫌犯罪，如盗窃、侵占等。
   • 措施：乙方可以向公安机关报案，要求追究甲方的刑事责任。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，盗窃、侵占他人财物，数额较大或者有其他严重情节的，可能构成犯罪，应当受到刑事处罚。

行动建议：

• 乙方在采取任何措施前，应确保自己拥有充分的证据证明对备案文档的所有权或合法持有权，如文档的创作记录、版权登记证书、与甲方的合作协议等。
• 在处理过程中，乙方应保持冷静和理性，避免采取过激行为导致事态恶化。
• 如对法律程序不熟悉，建议寻求专业法律人士的帮助，以确保自身权益得到有效维护。