申请执行人自行扣押债务人车辆的行为，在大多数情况下是不合法的，除非存在法律特别规定的情形。以下从不同角度为您详细分析：
一、法律原则与规定
私力救济的限制：
- 在法律上，私力救济（即个人自行采取措施保护自己的权益）通常受到严格限制。特别是在执行程序中，申请执行人不能自行采取强制措施，如扣押、查封债务人的财产。
- 根据《中华人民共和国民事诉讼法》及相关司法解释的规定，执行程序应由法院依法进行，包括查封、扣押、冻结等强制措施。申请执行人无权自行实施这些措施。
合法执行途径：
- 如果申请执行人认为债务人有可供执行的财产，如车辆，应向法院申请执行。法院在受理执行申请后，会依法进行调查，并在确认财产权属后，采取相应的执行措施。
- 申请执行人可以通过提供财产线索、协助法院执行等方式，参与执行过程，但不得自行采取强制措施。
二、非法扣押的法律后果
民事责任：
- 如果申请执行人非法扣押债务人的车辆，可能构成对债务人财产权的侵犯，债务人有权要求申请执行人返还车辆，并可能要求赔偿因此造成的损失。
行政责任与刑事责任：
- 在某些情况下，非法扣押行为可能违反治安管理处罚法，甚至可能构成犯罪（如非法拘禁罪、抢劫罪等），从而面临行政处罚或刑事责任。
三、特殊情况下的合法扣押
法律特别规定的情形：
- 虽然一般情况下申请执行人不能自行扣押债务人车辆，但在某些特殊情况下，如债务人同意或存在法律特别规定的情形（如债务人自愿将车辆交予申请执行人保管作为执行担保），扣押行为可能是合法的。
- 然而，这些特殊情况需要严格的法律条件和程序支持，不是普遍适用的。
法院授权或协助执行：
- 如果申请执行人获得法院的明确授权或协助执行通知书，在法院工作人员的指导下进行扣押，那么这种扣押行为是合法的。但这种情况非常罕见，且需要严格的法律程序。
四、建议与措施
申请执行人应怎么做：
- 如果申请执行人发现债务人有可供执行的财产，如车辆，应立即向法院申请执行，并提供相关财产线索。
- 在执行过程中，申请执行人应积极配合法院的工作，提供必要的协助和信息。
债务人应如何应对：
- 如果债务人的车辆被非法扣押，应立即向公安机关报案，并保留相关证据（如扣押现场的照片、视频、证人证言等）。
- 同时，债务人可以向法院申请执行异议，要求法院确认扣押行为的非法性，并返还被扣押的车辆。
总结来说，申请执行人自行扣押债务人车辆的行为在大多数情况下是不合法的。如果申请执行人认为债务人有可供执行的财产，应通过合法途径向法院申请执行。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。