法院在特定条件下可以向第三人执行扣押查封车辆。针对您提出的问题，我们需要从多个角度进行分析：
一、抵押权的设立与对抗效力
抵押权设立：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，抵押权的设立需要满足一定的形式要件和实质要件。如果被执行人将车辆抵押给第三人，但未按照法律规定办理抵押登记，那么该抵押权可能无法对抗善意第三人，也无法对抗法院的执行。
对抗效力：即便抵押权已经设立并办理了登记，如果该抵押权是在法院查封之后设立的，那么该抵押权同样无法对抗法院的执行。因为法院查封后，被执行人的财产即被限制处分，任何后续的抵押行为都可能被视为无效。
二、法院执行程序中的权利与义务
执行权利：法院在执行过程中，有权对被执行人的财产进行查封、扣押、冻结等措施。如果车辆属于被执行人的财产，且未被合法抵押给善意第三人，或者抵押行为存在瑕疵，那么法院有权对该车辆进行扣押查封。
第三人义务：如果第三人声称对车辆享有抵押权，那么第三人需要提供充分的证据证明其抵押权的合法性和有效性。如果第三人无法提供充分证据，或者其抵押权存在瑕疵，那么第三人应当配合法院的执行工作，交出车辆。
三、具体案例与法律实践
在实际的法律实践中，法院在处理类似案件时，会综合考虑多种因素，包括抵押权的设立时间、是否办理了登记、第三人是否善意等。如果法院认为抵押权无法对抗执行，或者第三人无法证明其抵押权的合法性和有效性，那么法院会依法对车辆进行扣押查封。
举例说明：假设被执行人甲将车辆抵押给第三人乙，但未办理抵押登记。后来，甲因债务纠纷被法院执行，法院查封了甲名下的车辆。此时，乙声称对车辆享有抵押权，但无法提供充分证据。在这种情况下，法院有权对车辆进行扣押查封，因为乙的抵押权未办理登记，无法对抗法院的执行。
四、建议与后续行动
核实抵押权：如果您是申请人，建议您核实被执行人与第三人之间的抵押权是否合法有效，包括是否办理了抵押登记、抵押合同是否合法等。
提供证据：如果您认为抵押权存在瑕疵或无法对抗执行，建议您向法院提供相关证据，以便法院作出公正的裁决。
配合执行：无论结果如何，都建议您配合法院的执行工作，遵守法律程序，以便尽快解决债务纠纷。
如果您在处理此类案件时遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。我会根据您的具体情况，提供全面、专业的法律服务。