结论：别家院子种树遮挡您菜园的行为是否违法，需根据具体情况判断，一般而言，若该行为未侵犯您的合法权益，则不构成违法；但若该行为侵犯了您的相邻权，如造成采光、通风等权益受损，则可能构成违法，您有权要求对方停止侵害、排除妨碍。
一、法律背景
在农村地区，宅基地和院子属于村民的合法财产，村民有权在自己的宅基地和院子上进行合理的使用和建设，包括种植树木。然而，这种使用和建设行为应当遵循一定的原则，即不得损害他人的合法权益，特别是相邻权。相邻权是指不动产的相邻各方因行使所有权或使用权而发生的权利义务关系，包括采光、通风、排水、通行等方面的权益。
二、情况分析
若种树行为未侵犯您的合法权益：
- 如果别家院子种树的位置、高度等未对您的菜园造成实质性的影响，如未遮挡阳光、未影响通风等，那么该行为一般不构成违法。因为村民有权在自己的宅基地和院子上进行合理的绿化和美化。
若种树行为侵犯了您的相邻权：
- 如果别家院子种树的位置、高度等导致您的菜园采光不足、通风不畅，或者树木的根系对您的菜园造成了损害，如破坏土壤结构、影响作物生长等，那么该行为可能构成对您相邻权的侵犯。
- 在这种情况下，您有权根据《民法典》中关于相邻权的规定，要求对方停止侵害、排除妨碍，甚至赔偿损失。具体来说，您可以先与对方协商解决，如果协商不成，可以向村委会或相关部门调解，也可以直接向人民法院提起诉讼。
三、法律建议
收集证据：
- 如果您认为别家院子种树的行为侵犯了您的相邻权，首先应当收集相关证据，如照片、视频、证人证言等，以证明对方的行为对您造成了实质性的影响。
与对方协商：
- 在收集到足够证据后，您可以尝试与对方进行协商，要求对方停止侵害、排除妨碍。协商时应当保持冷静和理性，避免情绪化的冲突。
寻求调解或诉讼：
- 如果协商不成，您可以向村委会或相关部门申请调解。调解是一种相对温和、高效的解决方式，有助于维护邻里关系的和谐。
- 如果调解无果，或者您认为调解结果无法满足您的需求，您可以向人民法院提起诉讼，要求对方承担相应的法律责任。
四、可能的法律后果
如果对方行为构成违法：
- 对方可能需要停止侵害、排除妨碍，甚至赔偿您的损失。具体赔偿金额和方式将根据实际情况和法院判决确定。
如果对方行为不构成违法：
- 那么您可能需要接受现状，或者通过其他方式（如调整菜园布局、增加照明设备等）来减轻对方行为对您的影响。
最后，如果您在处理此类问题时遇到任何困难或疑问，可以直接向我咨询。我将根据您的具体情况，提供更为详细和专业的法律建议。