渔船不服从防台应急管理，是可以受到处罚的。以下从法律条款、实际案例及处罚措施三个角度进行详细分析：
一、法律条款依据
根据《福建省实施<中华人民共和国渔业法>办法》第三十一条规定：“防抗台风等自然灾害应急期间，渔业船舶的所有者、经营者和船长以及养殖渔排等设施上的人员应当服从各级人民政府及防汛抗旱指挥部的撤离、转移上岸等统一决定和命令。”这一条款明确规定了渔船在防台应急期间必须服从的指令。
同时，该办法第五十二条对违反上述规定的行为设定了具体的处罚措施：“违反本办法第三十一条规定，有下列情形之一的，处五千元至二万元的罚款；情节严重的，可以依法暂扣或者吊销渔业船舶船长的职务船员证书。构成违反治安管理行为的，由公安机关依法给予处罚；构成犯罪的，依法追究刑事责任：…（三）渔业船舶进港后，防抗台风等自然灾害应急响应终止前又擅自出海的…”
二、实际案例
泉州市案例：在今年第5号台风“杜苏芮”应急响应期间，泉州市有11艘渔船拒不服从防台安全指令，擅自登船或提前出海，严重威胁渔民生命财产安全。泉州市县两级渔业执法机构迅速立案调查，对涉事渔船予以停航处理，并处以最高罚款2万元的行政处罚。
广东省案例：在今年第4号台风“丹娜丝”防御期间，汕头市9艘渔船严重违反省防总指令，超出规定时间回港。事后，汕头市三防指挥部对涉事渔船作出处理，包括发出《禁止渔船离港通知书》、对船主和船员进行宣传教育、责令改正违法行为、分别予以罚款以及暂扣渔业船员职务证书等处罚。
三、处罚措施
对于不服从防台应急管理的渔船，处罚措施主要包括：
罚款：根据违法情节的轻重，处以五千元至二万元不等的罚款。
停航处理：在接受教育、处罚完毕之前，禁止渔船离港。
暂扣或吊销职务船员证书：对于情节严重的违法行为，可以依法暂扣或者吊销渔业船舶船长的职务船员证书。
构成犯罪的，依法追究刑事责任：如果渔船不服从防台应急管理的行为构成犯罪，将依法追究刑事责任。
法律建议：
强化安全生产意识：渔船所有者、经营者和船长应充分认识到防台应急管理的重要性，强化安全生产意识，确保渔船和人员的安全。
密切关注气象信息：渔船应密切关注海洋气象信息，及时了解台风等自然灾害的动态，以便做出正确的应对措施。
严格遵守指令：在防台应急期间，渔船必须严格遵守各级人民政府及防汛抗旱指挥部的统一决定和命令，不得擅自出海或登船。
可能后果：
经济损失：不服从防台应急管理的渔船将面临罚款等经济损失。
停航损失：被停航处理的渔船在处罚期间无法进行渔业生产活动，将造成一定的经济损失。
法律责任：对于情节严重的违法行为，渔船所有者、经营者和船长可能面临暂扣或吊销职务船员证书等法律责任，甚至可能构成犯罪被追究刑事责任。
综上所述，渔船不服从防台应急管理是可以受到处罚的，且处罚措施较为严厉。因此，建议渔船所有者、经营者和船长严格遵守相关法律法规和指令，确保渔船和人员的安全。如有任何法律问题，可以直接向我咨询。